Onderzoeker
Sofie Van Landeghem
- Disciplines:Natuurlijke taalverwerking, Bioinformatica, Datamining
Affiliaties
- Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2007 → 31 dec 2014
Projecten
1 - 2 of 2
- Automatische ontleding van het biblioom om het dynamische gedrag van moleculaire netwerken te ontrafelenVanaf1 okt 2012 → 31 dec 2014Financiering: BOF - Andere acties, FWO mandaten
- Knowledge discovery voor biologische processen door de integratie van heterogene databronnenVanaf1 okt 2008 → 30 sep 2012Financiering: FWO mandaten, BOF - Andere acties
Publicaties
1 - 10 van 21
- Cell line name recognition in support of the identification of synthetic lethality in cancer from text(2016)
Auteurs: Suwisa Kaewphan, Sofie Van Landeghem, Tomoko Ohta, Yves Van de Peer, Filip Ginter, Sampo Pyysalo
Pagina's: 276 - 282 - Diffany: an ontology-driven framework to infer, visualise and analyse differential molecular networks(2016)
Auteurs: Sofie Van Landeghem, Thomas Van Parys, Marieke Dubois, Dirk Inzé, Yves Van de Peer
- The KnownLeaf literature curation system captures knowledge about Arabidopsis leaf growth and development and facilitates integrated data mining(2015)
Auteurs: Dora Szakonyi, Sofie Van Landeghem, Katja Baerenfaller, Lieven Baeyens, Rubén Casanova-Sáez, Stefanie De Bodt, David Esteve-Bruna, Fabio Fiorani, Nathalie Gonzalez Sanchez, Jesper Grønlund, et al.
Pagina's: 1 - 11 - What is stress? : dose-response effects in commonly used in vitro stress assays(2014)
Auteurs: Hannes Claeys, Sofie Van Landeghem, Marieke Dubois, Katrien Maleux, Dirk Inzé
Pagina's: 519 - 527 - The potential of text mining in data integration and network biology for plant research : a case study on Arabidopsis(2013)
Auteurs: Sofie Van Landeghem, Stefanie De Bodt, Zuzanna Drebert, Dirk Inzé, Yves Van de Peer
Pagina's: 794 - 807 - Large-scale event extraction from literature with multi-level gene normalization(2013)
Auteurs: Sofie Van Landeghem, Jari Bjorne, Chih-Hsuan Wei, Kai Hakala, Sampo Pyysalo, Sophia Ananiadou, Hung-Yu Kao, Zhiyong Lu, Tapio Salakoski, Yves Van de Peer, et al.
- pico-PLAZA, a genome database of microbial photosynthetic eukaryotes(2013)
Auteurs: Klaas Vandepoele, Michiel Van Bel, Guilhem Richard, Sofie Van Landeghem, Bram Verhelst, Hervé Moreau, Yves Van de Peer, Nigel Grimsley, Gwenael Piganeau
Pagina's: 2147 - 2153 - Semantically linking molecular entities in literature through entity relationships(2012)
Auteurs: Sofie Van Landeghem, Jari Björne, Thomas Abeel, Tapio Salakoski, Yves Van de Peer
- PubMed-scale event extraction for post-translational modifications, epigenetics and protein structural relations(2012)
Auteurs: Jari Björne, Sofie Van Landeghem, Sampo Pyysalo, Tomoko Ohta, Filip Ginter, Yves Van de Peer, Sophia Ananiadou, Tapio Salakoski
Pagina's: 82 - 90 - Playing hide and seek on the genomic playground: unveiling biological function from literature(2012)
Auteurs: Sofie Van Landeghem