Onderzoeker
Petra Van Damme
- Trefwoorden:genoom (re-)annotatie, (alternatieve) translatie initiatie, bacteriële pathogeen, proteovormen, proteomics, riboproteogenomics, gastheer-microbe interactie
- Disciplines:Transcriptie en translatie, Proteomics, Transcriptomics, Interactomics, Infectieziekten
Affiliaties
- Vakgroep Biochemie en Microbiologie (Departement)
Lid
Vanaf1 mrt 2019 → Heden - Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → 28 feb 2019 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 mei 2018 → 30 sep 2018 - Vakgroep Biochemie (Departement)
Lid
Vanaf1 feb 2003 → 30 sep 2018 - Vakgroep Biomedische Moleculaire Biologie (Departement)
Lid
Vanaf1 jan 2002 → 31 aug 2002
Projecten
1 - 10 of 10
- Nieuwe mechanismen van ontsteking en celdood regulatie in autoinflammatoire ziekten en infectiesVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Microarrays voor de fenotypische karakterisatie van reinculturen, bacteriële mutanten en microbiële gemeenschappenVanaf15 dec 2022 → HedenFinanciering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Het ontrafelen van de heterogene aard van gastheer/pathogeen interacties en hun rol in bacteriële pathogenese.Vanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Preparatieve en analytische ultracentrifugatie ter ondersteuning van integratieve multi-omics studies.Vanaf1 dec 2020 → 30 nov 2022Financiering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Een MALDI-8020 massaspectrometer voor analyse van peptiden en eiwitten.Vanaf1 dec 2020 → 30 nov 2022Financiering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Riboproteogenomics van het sORF-gecodeerde SalmonellapeptidoomVanaf1 jan 2020 → 31 dec 2023Financiering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Proteogenomics exploratie van de moleculaire mechanismen die aan de basis liggen van Salmonella infectieVanaf1 okt 2019 → 31 mrt 2022Financiering: BOF - postdoctorale mandaten
- Riboproteogenomics van de interactie tussen bacteriële pathogeen en zijn gastheerVanaf15 apr 2019 → 14 feb 2024Financiering: BOF - projecten
- PROFETIE: Translationele controle in infectiebiologie: riboproteogenomics van bacteriële pathogenenVanaf1 nov 2018 → 31 okt 2023Financiering: H2020-EU.1.1 - EXCELLENT SCIENCE - Europese Onderzoeksraad (ERC)
- BOF-ZAP-ambt in proteomicaVanaf1 okt 2018 → HedenFinanciering: BOF - ZAP BOF mandaten
Publicaties
1 - 10 van 38
- Identification of plant protein-metabolite interactions by limited proteolysis-coupled mass spectrometry (LiP-MS)(2023)Series: Methods in Molecular Biology
Auteurs: Jhon Jairo Venegas Molina, Petra Van Damme, Alain Goossens, Aleksandra Skirycz, Marcin Luzarowski, Jennifer C. Ewald
Pagina's: 47 - 67 - Cataloguing protein complexes in planta using TurboID-catalyzed proximity labeling(2023)Series: Methods in Molecular Biology
Auteurs: Lore Gryffroy, Joren De Ryck, Veronique Jonckheere, Sofie Goormachtig, Alain Goossens, Petra Van Damme, Shahid Mukhtar
Pagina's: 311 - 334 - Exposing the small protein load of bacterial life(2023)
Auteurs: Laure Simoens, Igor Fijalkowski, Petra Van Damme
- N-terminal acetyltransferase Naa40p whereabouts put into N-terminal proteoform perspective(2021)
Auteurs: Veronique Jonckheere, Petra Van Damme
- Capturing salmonella SspH2 host targets in virus-like particles(2021)
Auteurs: Margaux De Meyer, Igor Fijalkowski, Veronique Jonckheere, Delphine De Sutter, Sven Eyckerman, Petra Van Damme
- Small protein enrichment improves proteomics detection of sORF encoded polypeptides(2021)
Auteurs: Igor Fijalkowski, Marlies Peeters, Petra Van Damme
- Charting the N-terminal acetylome : a comprehensive map of human NatA substrates(2021)
Auteurs: Petra Van Damme
- Bacterial riboproteogenomics : the era of N-terminal proteoform existence revealed(2020)
Auteurs: Daria Fijalkowska, Igor Fijalkowski, Patrick Willems, Petra Van Damme
Pagina's: 418 - 431 - Lost and found : re-searching and re-scoring proteomics data aids genome annotation and improves proteome coverage(2020)
Auteurs: Patrick Willems, Igor Fijalkowski, Petra Van Damme
- PROTEOFORMER 2.0 : further developments in the ribosome profiling-assisted proteogenomic hunt for new proteoforms(2019)
Auteurs: Steven Verbruggen, Elvis Ndah, Wim Van Criekinge, Siegfried Gessulat, Bernhard Kuster, Mathias Wilhelm, Gerben Menschaert, Petra Van Damme
Pagina's: S126 - S140