Onderzoeker
Vanessa Vermeirssen
- Trefwoorden:systeembiologie, bio-informatica, biologische netwerken, genregulatie
- Disciplines:Analyse van next-generation sequence data, Neurologische en neuromusculaire ziekten, Single-cell data analyse, Medische epigenomics, Medische genomics, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Computationele transcriptomics en epigenomics, Biologische psychiatrie, Computationele biomodellering en machine learning, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Kankerbiologie, Medische metabolomics, Medische transcriptomics
Affiliaties
- Vakgroep Biomedische Moleculaire Biologie (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2019 → Heden - Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 mrt 2007 → 30 sep 2017 - Vakgroep Biochemische en Microbiële Technologie (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 1999 → 30 sep 2003
Projecten
1 - 5 of 5
- Onderzoek naar bestralings-geinduceerde plasticiteit in Glioblastoma: van fundamentele inzichten naar patiëntgerichte therapeutische mogelijkhedenVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Gen regulatorische netwerken verwezenlijkt door transposon elementen in hersenziektesVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Het karakteriseren van regulatorische heterogeniteit in brein kanker aan de hand van cel specifieke netwerk inferentieVanaf1 nov 2021 → 30 apr 2023Financiering: FWO mandaten
- Multi-omics data integratie in de context van regulatorische netwerken om regulatorische metabolieten te detecteren in complexe ziekten zoals kanker en neuro-inflammatoire aandoeningenVanaf1 nov 2020 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Multi-omics data integratie voor het ophelderen van de oorzaken van complexe ziektenVanaf1 mrt 2020 → HedenFinanciering: BOF - projecten
Publicaties
1 - 10 van 16
- HTSplotter : an end-to-end data processing, analysis and visualisation tool for chemical and genetic in vitro perturbation screening(2024)
Auteurs: Carolina de Carvalho Nunes, Jasper Anckaert, Fanny De Vloed, Jolien De Wyn, Kaat Durinck, Jo Vandesompele, Franki Speleman, Vanessa Vermeirssen
- Evaluation of single-sample network inference methods for precision oncology(2024)
Auteurs: Joke Deschildre, Boris Vandemoortele, Jens Uwe Loers, Katleen De Preter, Vanessa Vermeirssen
- Human iPSC modeling recapitulates in vivo sympathoadrenal development and reveals an aberrant developmental subpopulation in familial neuroblastoma(2024)
Auteurs: Stéphane Van Haver, Yujie Fan, Sarah-Lee Bekaert, Celine Everaert, Wouter Van Loocke, Vittorio Zanzani, Joke Deschildre, Ines Fernandez Maestre, Adrianna Amaro, Vanessa Vermeirssen, et al.
- Molecular systems biology approaches to investigate mechanisms of gut-brain communication in neurological diseases(2023)
Auteurs: Boris Vandemoortele, Vanessa Vermeirssen
Pagina's: 3622 - 3632 - Opportunities and challenges in interpretable deep learning for drug sensitivity prediction of cancer cells(2022)
Auteurs: Bikash Ranjan Samal, Jens Uwe Loers, Vanessa Vermeirssen, Katleen De Preter
- SUBATOMIC : a SUbgraph BAsed mulTi-OMIcs clustering framework to analyze integrated multi-edge networks(2022)
Auteurs: Jens Uwe Loers, Vanessa Vermeirssen
- Whole transcriptome profiling of liquid biopsies from tumour xenografted mouse models enables specific monitoring of tumour-derived extracellular RNA(2022)
Auteurs: Vanessa Vermeirssen, Jill Deleu, Annelien Morlion, Celine Everaert, Jilke De Wilde, Jasper Anckaert, Kaat Durinck, Justine Nuytens, Muhammad Rishfi, Franki Speleman, et al.
- Maximal acyclic subgraph optimization for gene regulatory networks(2022)
Auteurs: Kenneth Stoop, Tom Michoel, Vanessa Vermeirssen, Mario Pickavet, Pieter Audenaert, Didier Colle
Pagina's: 73 - 74 - Whole transcriptome profiling of liquid biopsies from tumor xenografted mouse models enables specific monitoring of tumor-derived RNA(2022)
Auteurs: Vanessa Vermeirssen, Jill Deleu, Annelien Morlion, Celine Everaert, Kimberly Verniers, Tom Van Maerken, Bram De Wilde, Jo Vandesompele, Anneleen Decock
Aantal pagina's: 1 - Whole transcriptome profiling of liquid biopsies from tumor xenografted mouse models enables specific monitoring of tumor-derived RNA(2022)
Auteurs: Vanessa Vermeirssen, Jill Deleu, Annelien Morlion, Celine Everaert, Kimberly Verniers, Tom Van Maerken, Bram De Wilde, Jo Vandesompele, Anneleen Decock
Aantal pagina's: 1