Onderzoeker
Sofie Van Gassen
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Analyse van next-generation sequence data, Adaptieve immunologie, Bacteriologie
- Disciplines (Ghent University):Machine learning en besluitvorming, Bioinformatica, Datamining
Affiliaties
- Vakgroep Toegepaste Wiskunde, Informatica en Statistiek (Departement)
Lid
Vanaf1 jan 2018 → Heden - Saeys Lab (Onderzoeksgroep)
Lid
Vanaf1 jan 2017 → Heden - Vakgroep Informatietechnologie (Departement)
Lid
Vanaf4 jul 2013 → 31 dec 2017
Projecten
1 - 4 of 4
- Computationele cytometrie-technieken voor klinische toepassingen.Vanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: FWO senior postdoctoraal mandaat
- Klinische toepassingen van de computationele cytometrieVanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: BOF - postdoctorale mandaten
- Verbeteren van de diagnose en prognose van primaire immuundeficiënties met behulp van computationele flowcytometrieVanaf1 okt 2018 → 30 sep 2021Financiering: FWO mandaten
- Ontwikkeling van machine learning technieken voor flowcytometrie dataVanaf1 jan 2014 → 31 dec 2017Financiering: IWT persoonsgebonden financ. - specialisatiebeurzen
Publicaties
1 - 10 van 39
- Dysregulation of developmental and cell type-specific expression of glycoconjugates on hematopoietic cells : a new characteristic of myelodysplastic neoplasms (MDS)(2023)
Auteurs: Margot F. van Spronsen, Sophie Horrevorts, Claudia Cali, Theresia M. Westers, Sofie Van Gassen, Yvan Saeys, Sandra J. van Vliet, Yvette van Kooyk, Arjan A. van de Loosdrecht
Pagina's: 702 - 707 - Adjuvant dendritic cell-based immunotherapy after cytoreductive surgery and hyperthermic intraperitoneal chemotherapy in patients with malignant peritoneal mesothelioma : a phase II clinical trial(2023)
Auteurs: Michelle Dietz, Katrien Quintelier, Job P. van Kooten, Nadine L. de Boer, Madelief Vink, Alexandra R. M. Brandt-Kerkhof, Cornelis Verhoef, Yvan Saeys, Joachim G. J. V. Aerts, Marcella Willemsen, et al.
- Gut inflammation in axial spondyloarthritis patients is characterized by a marked type 17 skewed mucosal innate‐like T cell signature(2023)
Auteurs: Céline Mortier, Katrien Quintelier, Ann-Sophie De Craemer, Thomas Renson, Liselotte Deroo, Emilie Dumas, Eveline Verheugen, Julie Coudenys, Tine Decruy, Zuzanna Łukasik, et al.
Pagina's: 1969 - 1982 - Single-cell molecular profiling using ex vivo functional readouts fuels precision oncology in glioblastoma(2023)
Auteurs: Dena Panovska, Pouya Nazari, Basiel Cole, Pieter-Jan Creemers, Marleen Derweduwe, Lien Solie, Sofie Van Gassen, Annelies Claeys, Tatjana Verbeke, Elizabeth F. Cohen, et al.
- Protocol for large scale whole blood immune monitoring by mass cytometry and Cyto Quality Pipeline(2022)
Auteurs: P Rybakowska, Sofie Van Gassen, J Martorell Marugán, Katrien Quintelier, Yvan Saeys, ME Alarcón-Riquelme, C Marañón
- The Euroflow PID Orientation Tube in the diagnostic workup of primary immunodeficiency : daily practice performance in a tertiary university hospital(2022)
Auteurs: Jana Neirinck, Annelies Emmaneel, Jan Philippé, Sofie Van Gassen, Yvan Saeys, Xavier Bossuyt, Stefanie De Buyser, Mirjam van der Burg, Martin Perez-Andres, Alberto Orfao, et al.
- Operational tolerance after hematopoietic stem cell transplantation is characterized by distinct transcriptional, phenotypic, and metabolic signatures(2022)
Auteurs: Laetitia Dubouchet, Helena Todorov, Nicolas Vallet, Sofie Van Gassen, Aurelien Corneau, Catherine Blanc, Habib Zouali, Anne Boland, Jean-Francois Deleuze, Brian Ingram, et al.
- PeacoQC : peak-based selection of high quality cytometry data(2022)
Auteurs: Annelies Emmaneel, Katrien Quintelier, Dorine Sichien, Paulina Rybakowska, Concepcion Maranon, Marta E. Alarcon-Riquelme, Gert Van Isterdael, Sofie Van Gassen, Yvan Saeys
Pagina's: 325 - 338 - Presence of innate lymphoid cells in allogeneic hematopoietic grafts correlates with reduced graft-versus-host disease(2022)
Auteurs: Anna Kroeze, Vera van Hoeven, Myrddin W. Verheij, Annelies W. Turksma, Naomi Weterings, Sofie Van Gassen, Sacha S. Zeerleder, Bianca Blom, Carlijn Voermans, Mette D. Hazenberg
Pagina's: 302 - 310 - Stabilization of human whole blood samples for multicenter and retrospective immunophenotyping studies(2021)
Auteurs: Paulina Rybakowska, Catalina Burbano, Sofie Van Gassen, Nieves Varela, Rocio Aguilar-Quesada, Yvan Saeys, Marta E. Alarcon-Riquelme, Concepcion Maranon
Pagina's: 524 - 537