Genetische adaptatie van tong (Solea solea L.) onder invloed van natuurlijke en artificiële selectie.

Voor het beheer van commerciële mariene vissoorten is het belangrijk omnatuurlijke en antropogene selectieve invloeden op natuurlijke populaties te onderscheiden. In dit project wordt de invloed van overbevissing op functionele diversiteit bestudeerd door mogelijke genetische adaptatiein natuurlijke tongpopulaties op te sporen. Zowel historische tijdsreeksen (otolieten) als geografisch gescheiden populaties zullen genetisch geanalyseerd worden aan de hand van SNP merkers. Dit onderzoek bestaat uit vier doelstellingen: (1) de bioinformatische analyse van transcriptoomsequenties van tong om merkers te ontwikkelen, gekoppeld aan kandidaatgenen, die instaan voor relevante levensgeschiedeniskenmerken (groei, maturatie en temperatuuradaptatie). Vervolgens worden (2) hedendaagse en (3)historische tongpopulaties gegenotypeerd dmv zowel willekeurige SNP#s (neutraal) als geselecteerde SNP#s om zo een connectiviteits- en uitbijteranalyse uit te voeren op een geografische en temporele schaal. Hierdoorzal respectievelijk natuurlijke lokale adaptatie bestudeerd worden en mogelijke evolutionaire adaptieve verschuivingen onder invloed van overbevissing in kaart gebracht. Een correlatie analyse zal uitwijzen of deze polymorfismen gekoppeld zijn aan fenotypische variatie. (4) Tenslotte zal genetische adaptatie experimenteel gevalideerd worden in een gecontroleerde kweekpopulatie van tong, om de genetische en milieucomponenten in de genotype-fenotype koppeling in te schatten. Dit project zal het beheer van deze zwaarbeviste soort ten goede komen door de menselijke onomkeerbare effecten in kaart te brengen.

Trefwoorden:Sole solea L., Genetic adaptation, Next-generation sequencing, Aquaculture, Fisheries induced evolution, Connectivity, Management, SNPs

Disciplines:Dierkundige biologie, Visserij, Geologie, Aquatische wetenschappen, uitdagingen en vervuiling

Project type:PhD project