< Terug naar vorige pagina

Project

Analyse van proteïne- en nucleïnzuurcomplexen met behulp van niet-denaturerende ionenmobiliteits massaspectrometrie.

De vele functies van nucleïnezuren (DNA, RNA) hangen af van hun precieze 3D structuur en hoe ze interageren met proteïnen. Als we de moleculaire basis van ziekten of infecties willen begrijpen, dan moeten we de interacties die optreden tijdens de celcyclus en proteïnesynthese begrijpen.De proteïnen die interageren met nucleïnezuren zijn typisch nauw betrokken in de structuur en activiteit van het genoom. In dit doctoraatswerk zullen we werken op proteïne complexen die interageren met nucleïnezuren en die betrokken zijn bij de structurele en ruimtelijke organisatie van DNA en gen regulatie. Dit omvat de analyse van de structuur en samenstelling van cruciale cellulaire complexen en hun werkingsmechanismen, met behulp van natieve/niet-denaturerende massaspectrometrie (MS) en ionenmobiliteit spectroscopie (IM). Deze technieken laten toe informatie te verzamelen over massa en lading, maar ook over grootte en vorm van de bestudeerde moleculaire complexen.We zullen actief zijn in verschillende internationale samenwerkingsverbanden (Oxford, Bristol) die zich toeleggen op de studie van proteïnen die instaan voor het structureel onderhoud van chromosomen (SMC proteins) en de daar bij horende bindingspartners die het DNA organiseren tijdens de cel cyclus. Mijn project houdt ook in dat we nieuwe methoden ontwikkelen om op natieve/niet-denaturerende manier MS analyses te doen van proteïnen en proteïne/nucleïnezuur complexen, en het gebruik van modeleringstechnieken om de verkregen data te interpreteren en voorstellen te doen voor de globale structuur van de moleculaire complexen. Op deze manier hopen we informatie over de genoom-huishouding op moleculair niveau te kunnen verbinden met mechanismen van overerving en fysiologische adaptatie.
Datum:1 okt 2013 →  30 sep 2016
Trefwoorden:PROTEÏNECOMPLEX, MASSASPECTROMETRIE, STRUCTURELE BIOLOGIE, CHROMOSOMEN