Identificatie van nieuwe inhibitoren en activiteits-gebaseerde probes voor signal peptidase I

Bacteriële infecties zijn nog steeds een bedreiging voor de mensheid. Daarom is het belangrijk om nieuwe targets voor de volgende generatie antibiotica te vinden. Het bacteriële signal peptidase I is een essentieel serine protease met een ongangbare catalytische site. Het speelt een rol in secretie en wordt gezien als mogelijk aangrijppunt voor toekomstige medicijnen. In dit project willen wij een assay opzetten voor dit enzym een een kleine collectie moleculen testen die reactiviteit hebben voor serine residuen. De assay zelf is gebaseerd op een fluorogeen peptide substraat, compatibel met toekomstige high-throughput screening. De de testen moleculen hebben al reactiviteit tegen enige andere ongewoonlijke serine proteasen vertoond. Het is daarom aannemelijk dat sommige hiervan activiteit vertonen tegen signal peptidase I. De moleculen zullen vervolgens als "Activity-based probes" gebruikt worden.