< Terug naar vorige pagina

Project

Een universele nanoporie sensor voor single-molecule detectie.

Dit project heeft als doel de ontwikkeling van een single-molecule nanoporie biosensor voor de detectie en studie van proteïnen en andere macromoleculen. Nanoporie sensing steunt op het principe dat elk analyt datinterageert met een enkelvoudige nanoporie de ionenstroom doorheen de porie op een specifieke manier beïnvloedt. Dit project zal gebruik maken van een biologische nanoporie, Cytolysin A (ClyA), wiens dimensies compatibel zijn met de gemiddelde grootte van wateroplosbare proteïnen. We hebben reeds aangetoond dat ClyA in staat is om nauw verwante proteïnen (humaan en runder thrombine, 86% sequentie identiteit) van elkaar te onderscheiden. De ClyA nanoporie bezit echter geen intrinsieke selectiviteit,wat maakt dat meerdere proteïnen de porie kunnen binnendringen en het output signaal gecompliceerd wordt. In dit project zal het vermogen van ClyA om verscheidene biologisch relevante proteïnen (bv. kanker biomerkers) te onderscheiden getest worden. Bovendien zal getracht worden om de selectiviteit van ClyA te verhogen. Hiervoor zullen specifieke proteïne-bindende elementen genetisch gefuseerd of chemisch gekoppeld worden aan ClyA, om zo een selectiviteitsfilter te creëren aan de ingang van de porie (bv. specifieke peptiden), of om rechtstreeks gebruikt te worden voor de detectie van proteïnen van interesse (bv. monobodies). Uiteindelijk zal de ClyA biosensor in staat zijn om specifieke doelproteïnen in complexe biologische stalen te detecteren.
Datum:1 jan 2013 →  31 dec 2016
Trefwoorden:Chemical attachment, Biological nanopore, ClyA (HlyE, SheA), Electrophysiology, Single-molecule, Protein sensing, Genetic fusion
Disciplines:Biochemie en metabolisme, Systeembiologie, Medische biochemie en metabolisme
Project type:PhD project