Genomische geneeskunde voor bloedingen, tromboses en bloedplaatjesdefecten

Bloedplaatjes, de tweede meest voorkomende bloedcellen, spelen een essentiële rol in cardiovasculaire ziekten. Aangeboren bloedingen, tromboses en bloedplaatjesdefecten (BTPD) worden gekenmerkt door een uitgeproken genetische heterogeniteit. De lijst van verantwoordelijke genen voor bloedplaatjesvorming en functie, bloedingen en tromboses is blijven groeien tot 100 genen sinds de introductie van high-throughput sequencing (HTS) toepassingen in onderzoek. Dankzij het gebruikt van deze HTS toepassingen werd ook in de diagnostiek vooruitgang geboekt waarbij de opvolging en zelfs de behandeling van BTPD patiënten vooruit ging omdat deze ook vaak andere symptomen hebben naast hun bloedingen of tromboseproblemen. Genetisch onderzoek naar deze 100 genen bij patiënten waarbij men een vermoeden van een BTPD heeft, geeft een diagnose bij ongeveer 50% van de patiënten en bij 40% gaat dit dan om een nog niet eerder beschreven genetische variant terwijl totale genoomanalyse van deze negatieve BTPD patiënten verder kan speuren naar nieuwe kandidaatgenen waarbij nog eens ongeveer 10% van deze patiënten kan rekenen op een diagnose na analyse van de coderende (exonen) regios. Verder onderzoek is noodzakelijk om de ontbrekende BTPD te ontdekken en deze zoektocht zal zich ook moeten zich richten op familiale screening in plaats van enkel aangetaste leden, alternatieve vormen van overeving en het vinden van pathogene varianten buiten de exonen. Het ontrafelen van deze niet coderende regios is een grote uitdaging dat voor bloedcellen mogelijk zal zijn door de BLUEPRINT epigenoom data te gebruiken die voor deze cellen reeds beschikbaar zijn. Deze gegevens zullen aangevuld worden met RNAseq data van bloedplaatjes en megakaryocyten van patiënten met een ontbrekende diagnose. Daarnaast zal er aandacht geschonken worden aan de transitie van het gen-platform naar totale genoomanalyse in een diagnostisch kader. Het uitwisselen van genetische data op international schaal is essentieel en met behulp van experten zal men op deze manier een correcte genetische diagnose kunnen leveren aan nog meer BTPD patiënten omdat nieuwe genen vaak slechts in één enkele familie gevonden worden.

Trefwoorden:thrombosis, whole genomes, bleeding, inherited, RNAsequencing, platelets

Disciplines:Vasculaire ziekten