Directe integratieve sequencing van cellen van patiënten met acute lymfatische leukemie

Leukemie is een complexe ziekte die wordt veroorzaakt door de ophoping van oncogene laesies bij het ontwikkelen van lymfoïde cellen. Deze hematologische maligniteit vertoont uitgebreide genetische intra-tumorale heterogeniteit. We begrijpen echter nog steeds niet volledig hoe het zich ontwikkelt, het exacte type cellen waaruit het bestaat en de gevoeligheid van de verschillende cellen voor de behandeling. Om heterogeniteit te ontleden, is het essentieel om studies met eencellige resolutie uit te voeren. In dit project willen we een eencellig beeld met hoge resolutie bieden van de ontwikkeling van leukemie en de respons op de behandeling rechtstreeks uit patiëntenmonsters. We zullen twee moleculaire dimensies van dezelfde cel, DNA en RNA, onderzoeken in duizenden leukemische cellen per patiënt en op verschillende tijdstippen. Hiermee verwachten we te bepalen of het niveau van heterogeniteit kan worden gekoppeld aan de prognose en om subklonen (mogelijk met nieuwe mutaties) te identificeren die correleren met resistentie tegen geneesmiddelen en bijdragen aan de ontwikkeling van terugval. Uiteindelijk zullen de resultaten van dit project implicaties hebben voor risicostratificatie en toekomstige gepersonaliseerde geneeskunde op basis van de moleculaire profielen van geïndividualiseerde patiënten.