< Terug naar vorige pagina

Project

Het verband tussen chromosoomconformatie, 3D nucleaire DNA architectuur en genexpressie begrijpen in humane embryogenese op single cel resolutie

Ons begrip van hoe het DNA in een celkern georganiseerd is in hogere orde structuren is slechts rudimentair, maar cruciaal om variërende genexpressie en fenotypes van cellen in normaal en ziekte weefsel te begrijpen. In de eerste celcycli na de bevruchting in het bijzonder, vinden er drastische veranderingen plaats in de DNA architectuur alsook in genexpressie, die ertoe leiden dat cellen naar specifieke embryonale weefsels kunnen differentiëren. Wanneer deze processen foutlopen, kan dat leiden tot een spontane miskraam of ernstige ontwikkelingsstoornissen in de foetus of postnataal.
Het doel van dit project is om een nieuwe methode te ontwikkelen om zowel de 3D nucleaire DNA structuur als de genexpressie genoomwijd te bestuderen van éénzelfde cel. We zullen deze technologie vervolgens toepassen op alle individuele cellen van humane embryo’s in de verschillende stadia van hun ontwikkeling, en zo  fundamentele basiskennis ontwikkelen omtrent hoe de nucleaire DNA architectuur evolueert doorheen vroege embryogenese, hoe dit proces verbonden is met specifieke genexpressie patronen en dus cellulaire differentiatie en fenotypes, en hoe dit proces verstoord wordt door numerieke en structurele chromosomale anomalieën die zich vaak voordoen in embryo’s. De technologie zal eveneens toepasbaar zijn op andere weefsels om de normale ontwikkeling van organismen te begrijpen, alsook de etiologie van ziekten en veroudering.

Datum:1 jan 2020 →  31 dec 2023
Trefwoorden:chromosome conformation, 3D nuclear DNA architecture, gene expression, human embryogenesis, single-cell resolution
Disciplines:Transcriptie en translatie, Ontwikkelingsbiologie, Single-cell data analyse, Epigenetica, Genetica