Gekke wortelziekte: bepalen van de moleculaire processen die aan de basis liggen van de vorming van gekke wortels in tomaat na infectie met rhizogene agrobacteria

Bij tomatenplanten leidt de gekke wortelziekte, veroorzaakt door rhizogene agrobacteria, tot overmatige wortelgroei en geassocieerde opbrengstverliezen. Wereldwijd breidt deze ziekte zich zeer snel uit bij vruchtgroenten onder glas. Rhizogene agrobacteria bevatten een wortel-inducerend plasmide waarvan een deel (T-DNA) wordt getransfereerd naar de plant. Tot hiertoe werden moleculaire mechanismen die cruciaal zijn tijdens de interactie tussen tomatenwortels en Agrobacterium nog niet in detail bestudeerd. Dit project heeft daarom als doel een beter omvattend moleculair en fenotypisch beeld te brengen van de genen die betrokken zijn in de ontwikkeling van gekke wortelziekte. In eerste instantie zal er een vergelijkende genoomstudie worden uitgevoerd van verschillende Agrobacterium isolaten waarbij we genetische kenmerken willen identificeren die resulteren in een verschil in virulentie, ontwikkeling van gekke wortels of biofilm-vormende capaciteit. Vervolgens willen we het effect van mutaties in deze virulentiegenen op de ontwikkeling van gekke wortels meer in detail bestuderen. Samengevat willen we een beter beeld krijgen van de sleutelprocessen tijdens de ontwikkeling van gekke wortels.