< Terug naar vorige pagina

Project

Next-generation pathologie door MILAN: multiplex immunohistochemie en geavanceerde beeldanalyse

Pathologie (of de cellulaire analyse van weefsels) blijft een essentieel hulpmiddel om de juiste diagnose te stellen. De hoeveelheid info die is kan afgeleid worden uit histologische analyses is echter te beperkt en is de afgelopen 50 jaar niet gewijzigd. We stellen voor om een grote sprong voorwaarts te maken in de histopathologie door een geautomatiseerde multiplex-immunohistofluorescentiemethode (MILAN) te introduceren op basis van de high-throughput screening van meer dan 80 biomarkers in slechts één FFPE-weefselsectie met single-cell resolutie. Deze technologie, die gebruikt maakt van beeldanalyse, kan door pathologen en onderzoekers gebruikt worden om fenotypische veranderingen in afzonderlijke cellen van zieke weefsels te onderzoeken aan ongekende resolutie, waardoor het mogelijk wordt om markers te identificeren die gelinkt kunnen worden aan response op therapie. De MILAN-procedure omvat een hybride aanpak waarbij laboratorium- en computationele analyse worden geïntegreerd, die vervolgens als een allesomvattende service zal worden aangeboden. Alle instrumenten voor automatisering van de laboratoriumprocedures zijn onlangs geïnstalleerd (via investeringen van de afdeling pathologie, KUL-LRD en LKI) en zullen ons in staat stellen enorme hoeveelheden gegevens te genereren. Echter, voor de daaropvolgende computationele analyse van de resulterende beelden missen we nog de vereiste tools en flexibiliteit om maximale data-extractie en interpretatie te doen – zeker om het als commercieel product aan te bieden. Daarom hebben we onze eigen softwaretools ontwikkeld (oa. adhv artificiele intelligentie) die zijn afgestemd op het verwerken en analyseren van beelden van hoge kwaliteit, waardoor we veel verder kunnen gaan dan het louter meten van expressie levels van markers. Proof-of-concept van deze aanpak werd reeds bekomen (bijvoorbeeld multiplex-gebaseerde voorspelling van immunotherapie-respons bij melanoom), maar de pipelines en gebruikersinterface kunnen nog niet overweg met de vereiste doorvoer, automatisering, snelheid en kwaliteit die nodig is om deze next-generation pathologiediensten aan (inter-)nationale onderzoekers en bedrijven aan te bieden. Dit project zal zich daarom concentreren op de automatisering en optimalisatie van de speciale software-algoritmen en gebruikersinterface waarmee stakeholders complexe ziektetoestanden en biomarkers met ongekende resolutie zullen kunnen interpreteren.
Datum:1 jan 2020 →  31 dec 2021
Trefwoorden:multiplex-IHC, artifical intelligence, image analysis
Disciplines:Algemene diagnostiek