Ontwikkeling van nieuwe PKD2 inhibitoren met behulp van structurele biologie

Vandaag de dag, zijn verschillende klinische inhibitoren tegen PKD2 beschikbaar, maar deze inhibitoren werken op een aspecifieke en ATP-competitieve manier. PKD1 is zelfs een essentiële isoform van de PKD family. Recentelijk, heeft het gastlaboratorium een groep van inhibitoren AllStars (Allosterische Stabilisatoren), die PKD2 op een specifieke en allosterische manier inhiberen, geïdentificeerd. Bijgevolg is het hoofddoel van mijn project het analyseren en verbeteren van het potentieel van deze AllStars zowel in vitro als in cellulo. Ten eerste, ben ik de kinase assay, DSF en biologische assays aan het optimaliseren voor analyse van de inhibitie van de AllStars. Ten tweede, zal ik in vitro en in cellulo het getarget domein achterhalen en valideren via PKD isoforme domein verwisseling en Crispr-Cas gerichte mutagenese. Vervolgens, zal het getarget domein gekrystalliseerd worden met verschillende AllStars. De interacties tussen AllStars en dit domein zullen gebruikt worden in receptor gebaseerd drug design om een betere AllStars te ontwerpen. Deze nieuwe AllStars zullen opnieuw in de verschillende assays geanalyseerd worden en gekrystalliseerd met PKD2. Mijn project zal verschillende isoform specifieke PKD2 inhibitoren opleveren die een unieke intellectuele eigendom zijn voor klinische ontwikkeling.