< Terug naar vorige pagina

Project

Mechanisme van Gyrase-inhibitie door ParE en het counter- mechanisme van ParD (FWOTM961)

Om te kunnen overleven en groeien moeten bacteriën zich kunnen aanpassen aan een omgeving die continu in verandering is. Toxine- antitoxine (TA) systemen zijn kleine genetische elementen aanwezig in bacteriële genomen die bijdragen tot deze zogenaamde bacteriële stress respons. Dit is de pathway die o.a. het niveau van replicatie, transcriptie en translatie afstemt op de externe omgeving, o.a. de beschikbaarheid van nutriënten. TA systemen bestaan typisch uit twee genen: één gen codeert voor een "toxine" dat het basismetabolisme van de cel vertraagt of zelfs helemaal stopzet, het andere gen codeert voor een corresponderend antitoxine. Dit laatste reguleert de actie van het toxine en verhindert ongewenste celdood. TA systemen zijn zeer divers en een hele reeks verschillende onverwante families zijn reeds geïdentificeerd. Meestal richt het toxine zich op eiwitsynthese via een grote variëteit aan moleculaire mechanismen. Dit maakt TA systemen o.a. interessant in de ontwikkeling van nieuwe antibiotica.
De parDE family van TA systemen heeft Gyrase als doelwit en stabiliseert een covalent DNA-Gyrase adduct. Dit laatste vormt een blokkade voor de transcriptie en replicatie machinerie. Ondanks hun veelvuldig voorkomen blijven de moleculaire details van de werking van ParE toxines onbekend. Dit project stelt zich tot doel om via structurele biologie en biofysica het werkingsmechanisme van Vibrio cholerae te ontrafelen, alsook het bijhorende reddingsmechanisme van ParD2.
Datum:1 nov 2019 →  31 jan 2024
Trefwoorden:Protein science, gyrase poison
Disciplines:Moleculaire biofysica, Structurele biologie