Bundelen van krachten: Valorisatie van grote metabolieten- en enzymendatasets (KU Leuven) via computer geassisteerde modellering (Oxford University) om onze inzichten in het metabolisme van CAM-planten te vergroten

In dit onderzoek worden krachten van KU Leuven en Oxford University gebundeld om onze inzichten in het metabole netwerk van planten met ‘Crassulacean Acid Metabolism’ (CAM) te vergroten. De onderzoeksgroep van Prof. Sweetlove (Oxford University) heeft onlangs een meer-fasemodel ontwikkeld voor CAM door middel van computer geassisteerde modellering. Dit model kan de dynamiek in metabolieten tijdens de cyclus in beeld brengen met een resolutie van 2 uur, maar heeft vele vrijheidsgraden, wat resulteert in verschillende mogelijke fluxmodi. De innovatieve aanpak van het combineren van unieke CAM-datasets die zijn samengesteld aan de KU Leuven, die tientallen metabolieten en enzymactiviteiten bevatten in het CAM-blad van Phalaenopsis, met computationele modellering zal het mogelijk maken om uit de vele fluxoplossingen diegene te kiezen die overeenstemmen met de biologische realiteit. Het onderzoek zal niet alleen bijdragen tot een beter begrip van de metabolische dynamiek van CAM planten, maar ook tot de ontwikkeling van strategieën voor metabole engineering voor de bio-engineering van CAM in niet-CAM-gewassen.

Trefwoorden:crassulacean acid metabolism, enzyme kinetics, metabolite dynamics, systems biology

Disciplines:Andere biotechnologie, bio-en biosysteem ingenieurswetenschappen niet elders geclassificeerd