< Terug naar vorige pagina

Project

In kaart brengen van het morfologische landschap van amyloïdeaggregaten met atoomkrachtmicroscopie en infraroodspectroscopie.

Amyloïden vertonen een structurele diversiteit op basis van hun aggregatietoestand (oligomeren, zaden, fibrillen, …) en kunnen verschillende structurele polymorfen vormen. Van cruciaal belang is dat deze diversiteit gecorreleerd is met verschillen in het ziektebeeld. Dit project bestudeert de verschillen tussen amyloïdestructuren in vivo en in vitro en hoe polymorfisme correleert met het ziektebeeld. Cryo-elektronenmicroscopie is van cruciaal belang geweest bij het bepalen van de structuren van amyloïde aggregaten met atomaire resolutie, maar er is nood aan een screeningsmethode die een betrouwbare en efficiënte analyse van amyloïdepolymorfen mogelijk maakt zonder de noodzaak voor extractieprocedures. Ik zal concentreren op structureel polymorfisme van twee modellen van amyloïdevormende eiwitten (Abeta en tau) met behulp van monsters van toenemende complexiteit. Ik zal een high-tech benadering (atoomkrachtmicroscopie - infrarood spectroscopie) gebruiken om de impact van de reactiecondities tijdens de groei op de structurele diversiteit van in vitro-geproduceerde amyloïdeaggregaten te bestuderen. Deze resultaten zullen vergeleken worden met in situ en ex vivo aggregaten in modelcellijnen en diermodellen. Aan de hand van een nietgesuperviseerde computationele aanpak voor clusteranalyse zal ik de impact van experimentele condities tijdens fibrilvorming en extractie op fibrilstructuur, voortplantingscapaciteit, en de beperkingen van structurele compatibiliteit onderzoeken.

Datum:1 aug 2021 →  Heden
Trefwoorden:Amyloid structural polymorphism, Single-particle infrared absorption spectroscopy, High-throughput structural analysis
Disciplines:Datavisualisatie en high-throughput beeldanalyse, Neurologische en neuromusculaire ziekten, Spectroscopische methoden
Project type:PhD project