< Terug naar vorige pagina

Project

Gecombineerde transcriptomische en electrofysiologische spatiotemporele profilering van neurale circuits met een hoge-densiteit multi-electrode rooster chip

Het bestuderen van cellulaire netwerken zoals neurale circuits op het niveau van 1 enkele cel is essentieel voor het begrijpen van complexe aandoeningen zoals neurodegeneratieve ziekten. Sinds het begin van de volgende generatie sequencing-technologieën en de kracht van stamceltechnologie, is het nu mogelijk om het transcriptomische profiel van duizenden cellen van patiënten met slecht begrepen aandoeningen te onthullen. Aan de andere kant laten neurale circuits, zelfs in (vereenvoudigde) gekweekte omstandigheden, ingewikkelde en ultrasnelle communicatie zien. Elektrodenreeksen op chip, met hoge dichtheid en uitgebreide gegevensverwerking, worden gebruikt om ziektefenotypes van deze in vitro circuits te identificeren. Een combinatie van transcriptomics en elektrofysiologie op het niveau van een enkele cel is tot op heden echter niet bereikt. Imec's high-density microelectrode array (HD-MEA) platform is een krachtig instrument om cellulaire netwerken te bestuderen met een resolutie van één cel. Met meer dan 16k elektroden en een elektrodeafstand van 15um maakt de nanochip het mogelijk om cellulaire processen op ongekend niveau te bestuderen. Het beschikt over verschillende modaliteiten, zoals elektrische stimulatie, elektroporatie, elektrofysiologische opname en impedantiespectroscopie om een verscheidenheid aan celtypen en tests te bestuderen. Dit systeem zal worden gebruikt om een volledig nieuw type integratieve single cell analysemethode te ontwikkelen op basis van elektroporatie en gemultiplexte barcodes.

Datum:26 aug 2021 →  Heden
Trefwoorden:RNA Sequencing, Single-cell sequencing, Spatial transcriptomics, High density microelectrode array, neural circuit profiling, Neural circuit, Microfluidics, Electroporation
Disciplines:Single-cell data analyse, Neurofysiologie, Transcriptomics
Project type:PhD project