Synthese van gemodificeerde PNA probes voor sequentie-selectieve G-quadruplex fotoalkylering.

De intrinsieke neiging van guanine-rijke sequenties om te vouwen in G-quadruplexen (G4s) is een uitgebreid bestudeerd fenomeen. Deze G4s zijn alternatieve, secundaire nucleïnezuur structuren, te vinden in belangrijke gebieden van het genoom en transcriptoom. Hun potentiële rol in de fijne regulatie van genexpressie toont hun potentieel als biologisch target voor medicijnontwerp aan. Er werden reeds veel kleine moleculen gerapporteerd die de G4-architectuur stabiliseren, induceren of zelfs ontregelen via niet-covalente interacties. De OBCR groep heeft recent een nieuwe alkyleringsmethodologie aangetoond, gebaseerd op de introductie van een pro-reactieve furaan eenheid in een G4-ligand. Bij bestraling met rood licht in aanwezigheid van een lokale G4-bindende photosensitizer, trad selectieve alkylering van de G4 op tov dubbelstrengig DNA. Echter, het voornaamste probleem binnen dit veld voor het gebruik naar therapeutische applicaties toe, blijft de G4-sequentie-specificiteit. In dit PhD voorstel trachten we sequentie-selectieve cross-linking te bereiken van een unieke G4 door herkenningselementen te implementeren in onze cross-link methodologie, door de flankerende regio’s van de gewenste G4 te targeten om zo het ligand dichtbij de gewenste G4 te brengen. Ons finaal doel zal zijn om een formulatie te ontwikkelen om ons systeem in een cellulaire context te kunnen afleveren, gebruikmakende van pre-miR-92b als target om onze methodologie te beoordelen in een biologische context.