Karakterisatie van de ontwikkeling en heterogeniteit van het darmkanker tumor ecosysteem

De meeste darmtumoren ontwikkelen traag in het colon waar ze interageren met het immuunsysteem en de microbiota. De Tejpar groep heeft via ‘single cell RNA sequencing’ karakteristieke immuun en epepitheliale merkers kunnen identificeren in de tumor omgeving. Deze data en interactie analyse wijzen op belangrijke signaalwegen in tumor ontwikkeling en immuunrespons, en hun heterogeniteit. Echter gaat door de dissociatie procedure nodig voor single cell sequencing de ultrastructuur van de tumor verloren. Daarom ga ik in dit project de resultaten en hypotheses uit deze experimenten vertalen voor histologische karakterisatie om celtypes en hun interacties te bevestigen en verfijnen. Hierin bekijk ik ook de intra-tumor heterogeniteit en zal ik karakteristieke structuren voor inter-en intra tumor heterogeniteit identificeren en linken aan tumor ontwikkeling, staat, progressie en prognose. Met dit werk wil ik therapeutische doelwitten prioritariseren en de histologische karakterisatie van darmtumoren verbeteren.