Derde generatie sequencing voor de detectie van cryptische structurele genoom en methyloom variatie in patienten met ontwikkelingsstoornissen.

Twee decennia geleden werd de voltooiing aangekondigd van een kaart van het menselijk genoom. Die is essentieel gebleken bij het bepalen van de genetische basis van ziektes. Helaas kon 10% van het genoom niet worden geanalyseerd. Ongeveer 40% van de patiënten blijft tot op vandaag zonder moleculaire verklaring voor hun aandoening. Nu kunnen we, door middel van revolutionaire long read sequencing-technologie, voor het eerst deze verborgen delen van ons DNA analyseren en complexere structurele varianten alsook epigenetische (methylatie) veranderingen opsporen. Met dit project willen we de hypothese testen dat deze tot nog toe verborgen regios een belangrijke deel van de onverklaarde verstandelijke beperking en multipele congenitale afwijkingen kan verklaren. We zullen de mogelijkheden en kracht van nanopore sequencing bepalen via analyse van referentiestalen. Vervolgens zullen we de genomen van 50 patiënten zonder moleculaire diagnose en beide ouders in kaart brengen. We zullen een noodzakelijke maar momenteel onbestaande structurele variatie referentiedatabank genereren die toelaat zowel coderende, niet-coderende structurele varianten als methylatie afwijkingen te onderzoeken om (mogelijk) pathogene varianten te identificeren. Een moleculaire diagnose is belangrijk om gepaste zorg, therapieën en familie counseling aan te bieden. Onze studie zal eveneens de deur openen voor de implementatie van 3de generatie sequencing, een belangrijke stap naar gepersonaliseerde geneeskunde.