Het decoderen van de impact van intercellulaire communicatie op de identiteit van tumortoestanden bij epitheliale kankers (CONTACT)

Verschillende cellulaire toestanden (TS,“tumor states”) komen voor in tumoren, waarbij sommige kankercellen
actief delen, anderen differentiëren, naburig weefsel invaderen, uitzaaiingen veroorzaken of verkeren in een
toestand die resistent is tegen therapie. De identificatie van de intrinsieke en extrinsieke mechanismen die TS
diversiteit moduleren is essentieel voor de ontwikkeling van nieuwe therapeutische strategieën. In dit project
bestuderen we het belang van de cellulaire communicatie tussen tumor en stroma, op de gen-regulatorische
netwerken (GRN) die TS reguleren in huidkanker. We maken gebruik van single-cell lineage tracing, single-cell
spatiale multi-omics, microfluidica, en bio-informatica, om het spatiale voorkomen van de verschillende TS en
hun naburige stromale cellen in kaart te brengen; en om de impact te bepalen van deze cellulaire en
moleculaire (e.g., ligand/receptor) interacties op de GRNs die TS identiteit controleren. We zullen dynamische
modellen gebruiken om te onderzoeken hoe deze interacties veranderen gedurende tumorprogessie,
metastase, en therapie-respons. Verder zullen we functioneel onderzoeken hoe het assembleren of verbreken
van cel-interacties tussen stroma en tumor of het verbreken van hun onderlinge moleculaire communicatie, de
GRNs van verschillende TS beïnvloeden. Tenslotte zullen we bestuderen hoe farmacologische interventies die
inwerken op de stroma-tumor communicatie, de tumorgroei, metastase, en therapie-resistentie kunnen
inperken.