Wereldwijde variatie van genotypes die coderen voor de bacteriële afbraak van een pesticide: vertelt het ons iets over de wereldwijde oorsprong, evolutie en distributie van catabolische genfuncties?

Ondanks hun “xenobiotische” structuur en de korte tijdsduur waarin
pesticiden toegepast werdenn in onze omgeving, bevatten bacteriën
katabolische routes om deze stoffen af te breken en erop te groeien.
Een opmerkelijke waarneming is dat, alhoewel afkomstig van
geografisch verschillende regio’s, bacteriële stammen die eenzelfde
pesticide afbreken dezelfde metabolische route gebruiken gecodeerd
door gelijkaardig genclusters alhoewel met verschillen in
nucleotidevolgorde en organisatie. De vraag is of dergelijke
metabolische routes/genclusters zich onafhankelijk van elkaar
verspreid en eventueel verder ontwikkeld hebben, vanuit een paar
locaties. Momenteel beschikken we nog over te weinig informatie om
deze vraag te beantwoorden. Bovendien is er enkel informatie van
organismen die in cultuur werden gebracht. Dit project zal de
wereldwijde inter- en intraveld variatie onderzoeken van het tfd
genotype dat codeert voor de afbraak van het herbicide 2,4-D, in
velden behandeld met 2,4-D, dit via zowel een cultivatie-afhankelijke
als cultivatie-onafhankeling benadering. We onderzoeken of we
regio-specifieke tfd genotypes kunnen herkennen alsmede de
wereldwijde verspreiding ervan. Deze informatie zal gerelateerd
worden met kenmerken zoals het DNA element dat het tfd genotype
draagt, lokale microbiele samenstelling en
omgevings/klimaateigenschappen en antropogene activiteiten om
onderliggende factoren van tfd oorsprong en distributie aan te halen.