< Terug naar vorige pagina

Project

Het ontrafelen van de link tussen HLA-presentoom en de verschillende klinische presentaties van cutane leishmaniasis met Nanopore HLA genotypering.

Infectie met Leishmania parasieten kan een divers spectrum aan klinische manifestaties veroorzaken. Deze kunnen gaan van diverse cutaneuze presentaties tot een dodelijke viscerale ziekte, elk geassocieerd met een specifieke set van Leishmania species. Tot nu toe is onze kennis over de gastheer-pathogeen interacties achter dit divers klinische spectrum erg beperkt. In ons recente werk hebben we een link aangetoond tussen het HLA-genotype en de susceptibiliteit om leishmaniasis te ontwikkelen. Daarom stellen we in dit project de hypothese naar voor dat differentiële T cel antigeen presentatie - gedreven door HLA diversiteit - een belangrijke mechanisme zou kunnen zijn voor de ontwikkeling van verschillende klinische presentaties van leishmaniasis. Specifiek wil dit project ontrafelen of en hoe differentiële antigeen presentatie en HLA diversiteit geassocieerd is met de verschillende cutaneuse presentaties van de ziekte. Concreet zal het project gebruik maken van Oxford Nanopore sequencing voor HLA genotypering met state-of-the-art in silico antigen presentatie predicties. Stalen zullen afgenomen worden van Ethiopische patiënten geïnfectreerd met L. aethiopica, omdat deze soort alle verschillende vormen cutaneuze leishmaniasis kan veroorzaken.
Datum:1 apr 2022 →  31 mrt 2023
Trefwoorden:NANOPORE SEQUENCING, IMMUNOINFORMATICA, LEISHMANIA
Disciplines:Bio-informatica van ziekten, Parasitologie, Immunogenetica