Onderzoeker
Filip Van Nieuwerburgh
- Trefwoorden:Massively parallel sequencing, Toegepaste bio-informatica
- Disciplines:Farmogenetica en -genomica, Genetica, Epigenetica, Immunogenetica
Affiliaties
- Vakgroep Geneesmiddelenleer (Departement)
Lid
Vanaf1 sep 1999 → Heden
Infrastructuur
1 - 1 van 1
- PromethION: nanopore sequencer met hoge doorvoer voor DNA en RNA sequenering met lange leeslengte. (Consortium coordinator)
Projecten
1 - 10 of 26
- Ontrafelen van de rol van het immuunsysteem bij de ontwikkeling van hypergranulatieweefsel in wonden bij paardenVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Extracellulaire vesikels uit het follikelvocht zijn sleutelfactoren voor een betere ontwikkeling van verse en gevitrificeerde eicellen bij het paardVanaf16 okt 2023 → HedenFinanciering: BOF - postdoctorale mandaten
- qPCR systeem voor kwaliteitscontrole van NGS staalvoorbereiding, meting van genexpressie, hybridisatiecurve, en smeltcurve analyseVanaf15 dec 2022 → HedenFinanciering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Cofinanciering kernfaciliteit - Gent Licht Microscopie (GLiM)Vanaf1 jul 2022 → HedenFinanciering: BOF - onderzoeksorganisaties
- Cofinanciering core facility - UGent NGS CoreVanaf1 jul 2022 → HedenFinanciering: BOF - onderzoeksorganisaties
- Modulaire high-end massaspectrometer voor ultragevoelige kwantificatie en beeldvorming van kleine organische moleculen in cross-health onderzoek - MSsmall-XHVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Empirische exploratie van nieuwe DNA probes voor hybridisatie met tandem repeatsVanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Nanopore-sequencing van complete farmacogenen na CRISPR/Cas9-verrijking bij tamoxifen- en clopidogrel-patiënten, waardoor verbeterde haplotypering en voorspelling van de werkzaamheid met machine learning mogelijk is.Vanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- PEA histon modificatie proteomicsVanaf1 mrt 2021 → 31 dec 2023Financiering: IOF - technologie validatie in labo
- Stimulated emission depletion microscopy (STED): Nanoscopie voor innovatief onderzoek in de levenswetenschappenVanaf1 mei 2020 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
Publicaties
11 - 20 van 274
- Identification of a novel idiopathic epilepsy risk locus and a variant in the CCDC85A gene in the Dutch partridge dog(2023)
Auteurs: Evy Beckers, Sofie Bhatti, Mario Van Poucke, Ingeborgh Polis, Frédéric Farnir, Filip Van Nieuwerburgh, Paul Mandigers, Luc Van Ham, Luc Peelman, Bart Broeckx
- Effects of biologics treatment in type 2-high chronic rhinosinusitis with nasal polyp patients(2023)Volume: 151
Auteurs: Sharon Van Nevel, Tim Meese, Gabriële Holtappels, Natalie De Ruyck, Stijn Vanhee, Nan Zhang, Filip Van Nieuwerburgh, Claus Bachert
Pagina's: AB187 - AB187 - How do engineered Yarrowia lipolytica strains secrete free fatty acids : hints from comparative transcriptomics(2023)
Auteurs: José Manuel Salvador López, Lea Vidal, Michelle Patricia, Filip Van Nieuwerburgh, Dieter Deforce, Jean-Marc Nicaud, Inge Van Bogaert
- Intrathymic dendritic cell-biased precursors promote human T cell lineage specification through IRF8-driven transmembrane TNF(2023)
Auteurs: Kai Ling Liang, Juliette Roels, Marieke Lavaert, Tom Putteman, Lena Böhme, Laurentijn Tilleman, Imke Velghe, Valentina Pegoretti, Inge Van de Walle, Stephanie Sontag, et al.
Pagina's: 474 - 486 - Systematic comparison of experimental and human obstructive cholestasis reveals conservation of canonical pathway activation and biomarkers relevant for cholestatic liver disease(2023)
Auteurs: Eva Gijbels, Kevin De Muynck, Bart Vanderborght, Tim Meese, Filip Van Nieuwerburgh, Anne Hoorens, Mathieu Vinken
Pagina's: 18 - 21 - Guar gum as galactomannan source induces dysbiosis and reduces performance in broiler chickens and dietary β-mannanase restores the gut homeostasis(2023)
Auteurs: Marielen De Souza, Venessa Eeckhaut, Evy Goossens, Richard Ducatelle, Filip Van Nieuwerburgh, Karl Poulsen, Ana Angelita Sampaio Baptista, Ana Paula Frederico Rodrigues Loureiro Bracarense, Filip Van Immerseel
- The multi-omics single-cell landscape of sinus mucosa in uncontrolled severe chronic rhinosinusitis with nasal polyps(2023)
Auteurs: Zhaofeng Xu, Yanran Huang, Tim Meese, Sharon Van Nevel, Gabriële Holtappels, Stijn Vanhee, Barbara M. Bröker, Zhengqi Li, Ellen De Meester, Natalie De Ruyck, et al.
- Severe udder cleft dermatitis lesion transcriptomics points to an impaired skin barrier, defective wound repair and a dysregulated inflammatory response as key elements in the pathogenesis(2023)
Auteurs: Anne-Sofie Vermeersch, Mohsin Ali, Yannick Gansemans, Filip Van Nieuwerburgh, Peter Geldhof, Richard Ducatelle, Dieter Deforce, Jozefien Callens, Geert Opsomer, Christophe Egles
Pagina's: e0288347 - RIPK1 kinase-dependent inflammation and cell death contribute to the pathogenesis of COPD(2023)
Auteurs: Hannelore Van Eeckhoutte, Chantal Donovan, Richard Y. Kim, Thomas M. Conlon, Meshal Ansari, Haroon Khan, Ranjith Jayaraman, Nicole G. Hansbro, Yves Dondelinger, Tom Delanghe, et al.
- Molecular analysis of broad-spectrum induced resistance in rice by the green leaf volatile Z-3-hexenyl acetate(2023)
Auteurs: Willem Desmedt, Maarten Ameye, Osvaldo Filipe, Evelien De Waele, Filip Van Nieuwerburgh, Dieter Deforce, Lieven Van Meulebroek, Lynn Vanhaecke, Tina Kyndt, Monica Höfte, et al.
Pagina's: 6804 - 6819
Patenten
1 - 2 van 2
- Hydrolysis-based probe and method for STR genotyping (Inventor)
- Probe and method for STR-genotyping (Inventor)