Onderzoeker
Klaas Vandepoele
- Trefwoorden (Ghent University):systeembiologie, bioinformatica, Plantenbiotechnologie
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Celdood en senescentie, Invasiebiologie, Epigenomics, Auto-ecologie, Biogeografie en fylogeografie
- Disciplines (Ghent University):Ontologieën, datacuratie en text mining, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Systeembiologie niet elders geclassificeerd, Cel- en moleculaire biologie van planten, Single-cell data analyse, Analyse van next-generation sequence data, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie
Affiliaties
- Vandepoele Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2018 → Heden - De Veylder Lab (Onderzoeksgroep)
Lid
Vanaf1 jan 2017 → 31 dec 2017 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 dec 2000 → Heden
Infrastructuur
1 - 1 van 1
- ELIXIR België (Consortium partner)
Projecten
1 - 10 of 18
- De verborgen tuin: adaptatie en evolutie van diatomeeën in benthische habitatsVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Beoordeling van de rollen van endogene en omgevingsfactoren die de celgrootteverdeling en seksuele reproductie in benthische diatomeeënpopulaties regelenVanaf1 nov 2022 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Het in kaart brengen van functionele componenten van de diverse levenscycli in diatomeeën.Vanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele celVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Identificatie van het gen regulerende netwerken vasculaire ontwikkeling in planten - een vergelijkende benadering op single-cell resolutieVanaf1 okt 2021 → 14 okt 2022Financiering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Enzym biodiscovery-pijplijnoptimalisatie via toolbox-ontwikkelingVanaf1 sep 2021 → HedenFinanciering: VLAIO - Catalisti - cSBO
- Software ontwikkeling voor ontdekking en prioritizering van genen belangrijk voor plant-eigenschappen op basis van single-cell moleculaire profilering.Vanaf1 jun 2021 → 31 dec 2023Financiering: IOF - technologie validatie in labo
- Reproductieve barrières, interspecifieke gene flow en diversificatie in een wereldwijd voorkomende pennate diatomeeVanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Van modelsysteem tot gewas: een network-gebaseerde benadering voor het accuraat vertalen van biologische kennis in plantenVanaf1 okt 2019 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- ELIXIR Infrastructuur voor Data en Services om Life-Sciences Onderzoek in Vlaanderen te versterkenVanaf1 jan 2019 → 31 dec 2022Financiering: FWO Internationale onderzoeksinfrastructuur (IRI)
Publicaties
1 - 10 van 133
- Diatom adhesive trail proteins acquired by horizontal gene transfer from bacteria serve as primers for marine biofilm formation(2023)
Auteurs: Jirina Zackova Suchanova, Gust Bilcke, Beata Romanowska, Ali Fatlawi, Martin Pippel, Alastair Skeffington, Michael Schroeder, Wim Vyverman, Klaas Vandepoele, Nils Kröger, et al.
Pagina's: 770 - 783 - Plant gene regulatory networks : methods and protocols(2023)
Auteurs: Kerstin Kaufmann, Klaas Vandepoele
- Predicting transcriptional responses to heat and drought stress from genomic features using a machine learning approach in rice(2023)
Auteurs: Helder Opdebeeck, Klaas Vandepoele
- A redundant transcription factor network steers spatiotemporal Arabidopsis triterpene synthesis(2023)
Auteurs: Trang Hieu Nguyen, Louis Thiers, Alex Van Moerkercke, Yuechen Bai, Patricia Fernandez Calvo, Max Minne, Thomas Depuydt, Maite Colinas Martinez, Kevin Verstaen, Gert Van Isterdael, et al.
Pagina's: 926 - 937 - Plant lineage-specific PIKMIN1 drives APC/CCCS52A2 E3-ligase activity-dependent cell division(2023)
Auteurs: Alex Willems, Yuanke Liang, Jefri Heyman, Thomas Depuydt, Thomas Eekhout, Balkan Canher, Hilde Van Den Daele, Ilse Vercauteren, Klaas Vandepoele, Lieven De Veylder
Pagina's: 1574 - 1595 - Distinctive and complementary roles of E2F transcription factors during plant replication stress responses(2023)
Auteurs: Maherun Nisa, Thomas Eekhout, Clara Bergis, José Antonio Pedroza-Garcia, Xiaoning He, Christelle Mazubert, Ilse Vercauteren, Toon Cools, Rim Brik-Chaouche, Jeannine Drouin-Wahbi, et al.
Pagina's: 1269 - 1282 - Characterization of gene regulatory networks in plants using new methods and data types(2023)Edition: 2Series: Methods in Molecular Biology
Auteurs: Klaas Vandepoele, Kerstin Kaufmann
Pagina's: 1 - 11 - Dicer-like 3a mediates intergenerational resistance against root-knot nematodes in rice via hormone responses(2023)
Auteurs: Aniko Meijer, Mohammad Reza Atighi Quchan Atigh, Kristof Demeestere, Tim De Meyer, Klaas Vandepoele, Tina Kyndt
Pagina's: 2071 - 2085 - Identification of growth regulators using cross-species network analysis in plants(2022)
Auteurs: Pasquale Luca Curci, Jie Zhang, Niklas Mähler, Carolin Seyfferth, Chanaka Mannapperuma, Tim Diels, Tom Van Hautegem, David Jonsen, Nathaniel Street, Torgeir R Hvidsten, et al.
Pagina's: 2350 - 2365 - JASPAR 2022 : the 9th release of the open-access database of transcription factor binding profiles(2022)
Auteurs: Jaime A Castro-Mondragon, Rafael Riudavets-Puig, Ieva Rauluseviciute, Roza Berhanu Lemma, Laura Turchi, Romain Blanc-Mathieu, Jeremy Lucas, Paul Boddie, Aziz Khan, Nicolás Manosalva Pérez, et al.
Pagina's: D165 - D173