Onderzoeker
Klaas Vandepoele
- Trefwoorden:systeembiologie, bioinformatica, Plantenbiotechnologie
- Disciplines:Datavisualisatie en high-throughput beeldanalyse, Ontologieën, datacuratie en text mining, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Systeembiologie niet elders geclassificeerd, Cel- en moleculaire biologie van planten, Single-cell data analyse, Analyse van next-generation sequence data, Structurele bio-informatica en computationele proteomics, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Bio-informatica van ziekten, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie
Affiliaties
- Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 dec 2000 → Heden
Projecten
1 - 9 of 9 results
- Van model systeem tot gewas: een network-gebaseerde benadering voor het accuraat vertalen van biologische kennis in plantenVanaf1 okt 2019 → HedenFinanciering: BOF - Nieuwe Onderzoeksinitiatieven
- De rol van niet-coderend RNAs in trangenerationele priming tegen nematoden in rijstVanaf1 okt 2018 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Gecontingenteerd ZAP-ambt in Moleculaire biologie van plantenVanaf1 feb 2016 → 31 jan 2021Financiering: BOF - Andere acties
- Sekssignalisatie en evolutie van de levenscyclus bij pennate diatomeeënVanaf1 jan 2015 → HedenFinanciering: BOF - Geconcert. Onderzoeksacties vanaf 1994
- Inter-species identificatie van genfuncties in planten op basis van RNA-Seq expressiedataVanaf1 jan 2015 → 31 dec 2018Financiering: IWT persoonsgebonden financ. - specialisatiebeurzen, IWT persoonsgebonden financ. - strategische onderzoeksbeurzen
- Detectie van genen met geconserveerde functies door middel van vergelijkend transcriptoom onderzoek in plantenVanaf1 jan 2015 → 31 dec 2020Financiering: FWO Onderzoeksproject
- Regulatorische annotatie van planten genomen door middel van functionele chromatine signaturen en vergelijkende sequentieanalyseVanaf1 dec 2012 → 31 aug 2016Financiering: IWT persoonsgebonden financ. - specialisatiebeurzen
- Onderzoek naar de organisatie en conservatie van transcriptionele regulatie in planten aan de hand van experimentele high-throughput dataVanaf1 okt 2010 → 5 jan 2016Financiering: IWT persoonsgebonden financ. - specialisatiebeurzen
- Bio-informatica: van nucleotids tot netwerken (N2N)Vanaf1 mei 2010 → 30 apr 2017Financiering: BOF - Andere acties
Publicaties
1 - 10 of 99 results
- Gene expression during bacterivorous growth of a widespread marine heterotrophic flagellate(2021)
Auteurs: Ramon Massana, Aurelie Labarre, David López-Escardó, Aleix Obiol, François Bucchini, Thomas Hackl, Matthias G. Fischer, Klaas Vandepoele, Denis V. Tikhonenkov, Filip Husnik, et al.
Pagina's: 154 - 167 - Mating type specific transcriptomic response to sex inducing pheromone in the pennate diatom Seminavis robusta(2021)
Auteurs: Gust Bilcke, Koen Van den Berge, Sam De Decker, Elias Bonneure, Nicole Poulsen, Petra Bulánková, Cristina Maria Osuna Cruz, Jack Dickenson, Koen Sabbe, Georg Pohnert, et al.
Pagina's: 562 - 576 - Integrative inference of transcriptional networks in Arabidopsis yields novel ROS signalling regulators(2021)
Auteurs: Inge De Clercq, Jan Van de Velde, Xiaopeng Luo, Li Liu, Véronique Storme, Michiel Van Bel, Robin Pottie, Dries Vaneechoutte, Frank Van Breusegem, Klaas Vandepoele
Pagina's: 500 - 513 - A network-based comparative framework to study conservation and divergence of proteomes in plant phylogenies(2021)
Auteurs: Junha Shin, Harald Marx, Alicia Richards, Dries Vaneechoutte, Dhileepkumar Jayaraman, Junko Maeda, Sanhita Chakraborty, Michael Sussman, Klaas Vandepoele, Jean-Michel Ané, et al.
Aantal pagina's: 1 - Inference of plant gene regulatory networks using data-driven methods : a practical overview(2020)
Auteurs: Shubhada Rajabhau Kulkarni, Klaas Vandepoele
Aantal pagina's: 1 - Neoproterozoic origin and multiple transitions to macroscopic growth in green seaweeds(2020)
Auteurs: Andrea Del Cortona, Christopher J. Jackson, François Bucchini, Michiel Van Bel, Sofie D'hondt, Pavel Skaloud, Charles F. Delwiche, Andrew H. Knoll, John A. Raven, Heroen Verbruggen, et al.
Pagina's: 2551 - 2559 - Light regulation of LHCX genes in the benthic diatom Seminavis robusta(2020)
Auteurs: Lander Blommaert, Emmelien Vancaester, Marie Huysman, Cristina Maria Osuna Cruz, Sofie D'hondt, Johann Lavaud, Bernard Lepetit, Per Winge, Atle M. Bones, Klaas Vandepoele, et al.
Aantal pagina's: 1 - Comprehensive and functional analysis of horizontal gene transfer events in diatoms(2020)
Auteurs: Emmelien Vancaester, Thomas Depuydt, Cristina Maria Osuna Cruz, Klaas Vandepoele
Pagina's: 3243 - 3257 - Identification and evolution of gene regulatory networks : insights from comparative studies in plants(2020)
Auteurs: Marc Jones, Klaas Vandepoele
Pagina's: 42 - 48 - Evolution of vascular plants through redeployment of ancient developmental regulators(2020)
Auteurs: Kuan-Ju Lu, Nicole van U+2019t Wout Hofland, Eliana Mor, Sumanth Mutte, Paul Abrahams, Hirotaka Kato, Klaas Vandepoele, Dolf Weijers, Bert De Rybel
Pagina's: 733 - 740