Onderzoeker
Klaas Vandepoele
- Trefwoorden:Technische en toegepaste scheikunde
- Disciplines:Datavisualisatie en high-throughput beeldanalyse, Ontologieën, datacuratie en text mining, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Systeembiologie niet elders geclassificeerd, Cel- en moleculaire biologie van planten, Single-cell data analyse, Analyse van next-generation sequence data, Structurele bio-informatica en computationele proteomics, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Bio-informatica van ziekten, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie
Affiliaties
- Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2005 → Heden
Projecten
1 - 8 of 8 results
- De rol van niet-coderend RNAs in trangenerationele priming tegen nematoden in rijstVanaf10 jan 2018 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Gecontingenteerd ZAP-ambt in Moleculaire biologie van plantenVanaf1 feb 2016 → HedenFinanciering: BOF - Andere acties
- Seks signalisatie en evolutie van de levenscyclus bij pennate diatomeeënVanaf1 jan 2015 → HedenFinanciering: BOF - Geconcert. Onderzoeksacties vanaf 1994
- Inter-species identificatie van genfuncties in planten op basis van RNA-Seq expressiedataVanaf1 jan 2015 → 31 dec 2018Financiering: IWT persoonsgebonden financ. - specialisatiebeurzen, IWT persoonsgebonden financ. - strategische onderzoeksbeurzen
- Detectie van genen met geconserveerde functies door middel van vergelijkend transcriptoom onderzoek in plantenVanaf1 jan 2015 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject
- Regulatorische annotatie van planten genomen door middel van functionele chromatine signaturen en vergelijkende sequentieanalyseVanaf1 dec 2012 → 31 aug 2016Financiering: IWT persoonsgebonden financ. - specialisatiebeurzen
- Onderzoek naar de organisatie en conservatie van transcriptionele regulatie in planten aan de hand van experimentele high-throughput dataVanaf1 okt 2010 → 5 jan 2016Financiering: IWT persoonsgebonden financ. - specialisatiebeurzen
- Bio-informatica: van nucleotids tot netwerken (N2N)Vanaf1 mei 2010 → 30 apr 2017Financiering: BOF - Andere acties
Publicaties
1 - 10 of 81 results
- Understanding genetic control of root system architecture in soybean : insights into the genetic basis of lateral root number(2019)Tijdschrift: Plant, Cell & EnvironmentISSN: 0140-7791Issue: 1Volume: 42
Auteurs: Silvas J Prince, Babu Valliyodan, Heng Ye, Ming Yang, Shuaishuai Tai, Wushu Hu, Mackensie Murphy, Lorellin A Durnell, Li Song, Trupti Joshi, et al.
Pagina's: 212 - 229 - A widespread alternative squalene epoxidase participates in eukaryote steroid biosynthesis(2019)Tijdschrift: Nature MicrobiologyIssue: 2Volume: 4
Auteurs: Jacob Pollier, Emmelien Vancaester, Unnikrishnan Kuzhiumparambil, Claudia E Vickers, Klaas Vandepoele, Alain Goossens, Michele Fabris
Pagina's: 226 - 233 - Capturing the phosphorylation and protein interaction landscape of the plant TOR kinase(2019)Tijdschrift: Nature PlantsVolume: 5
Auteurs: Jelle Van Leene, Chao Han, Astrid Gadeyne, Dominique Eeckhout, Caroline Matthijs, Bernard Cannoot, Nancy De Winne, Geert Persiau, Eveline Van De Slijke, Brigitte Van De Cotte, et al.
Pagina's: 316 - 327 - Gene space completeness in complex plant genomes(2019)Tijdschrift: Current Opinion in Plant BiologyISSN: 1369-5266Volume: 48
Auteurs: Michiel Van Bel, François Bucchini, Klaas Vandepoele, Steven Kelly
Pagina's: 9 - 17 - Ensemble gene function prediction database reveals genes important for complex I formation in Arabidopsis thaliana(2018)Tijdschrift: NEW PHYTOLOGISTISSN: 1469-8137Issue: 4Volume: 217
Auteurs: Bjoern Oest Hansen, Etienne H Meyer, Camilla Ferrari, Neha Vaid, Sara Movahedi, Klaas Vandepoele, Zoran Nikoloski, Marek Mutwil
Pagina's: 1521 - 1534 - The Physcomitrella patens chromosome-scale assembly reveals moss genome structure and evolution(2018)Tijdschrift: Plant JournalISSN: 0960-7412Issue: 3Volume: 93
Auteurs: Daniel Lang, Kristian K Ullrich, Florent Murat, Joerg Fuchs, Jerry Jenkins, Fabian B Haas, Mathieu Piednoel, Heidrun Gundlach, Michiel Van Bel, Rabea Meyberg, et al.
Pagina's: 515 - 533 - JASPAR 2018 : update of the open-access database of transcription factor binding profiles and its web framework(2018)Tijdschrift: Nucleic Acids ResearchISSN: 0305-1048Issue: D1Volume: 46
Auteurs: Aziz Khan, Oriol Fornes, Arnaud Stigliani, Marius Gheorghe, Jaime A Castro-Mondragon, Robin van der Lee, Adrien Bessy, Jeanne Cheneby, Shubhada Rajabhau Kulkarni, Ge Tan, et al.
Pagina's: D260 - D266 - TF2Network : predicting transcription factor regulators and gene regulatory networks in Arabidopsis using publicly available binding site information(2018)Tijdschrift: Nucleic Acids ResearchISSN: 0305-1048Issue: 6Volume: 46
Auteurs: Shubhada Rajabhau Kulkarni, Dries Vaneechoutte, Jan Van de Velde, Klaas Vandepoele
Aantal pagina's: 1 - GSyellow, a multifaceted tag for functional protein analysis in monocot and dicot plants(2018)Tijdschrift: Plant PhysiologyISSN: 0032-0889Issue: 2Volume: 177
Auteurs: Nienke Besbrugge, Jelle Van Leene, Dominique Eeckhout, Bernard Cannoot, Shubhada Rajabhau Kulkarni, Nancy De Winne, Geert Persiau, Eveline Van De Slijke, Michiel Bontinck, Stijn Aesaert, et al.
Pagina's: 447 - 464 - Genome analyses of the microalga Picochlorum provide insights into the evolution of thermotolerance in the green lineage(2018)Tijdschrift: GENOME BIOLOGY AND EVOLUTIONISSN: 1759-6653Issue: 9Volume: 10
Auteurs: Marc Krasovec, Emmelien Vancaester, Stephane Rombauts, François Bucchini, Sheree Yau, Claire Hemon, Hugo Lebredonchel, Nigel Grimsley, Herve Moreau, Sophie Sanchez-Brosseau, et al.
Pagina's: 2347 - 2365