Onderzoeker
Klaas Vandepoele
- Trefwoorden (Ghent University):systeembiologie, bioinformatica, Plantenbiotechnologie
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Celdood en senescentie, Invasiebiologie, Epigenomics, Auto-ecologie, Biogeografie en fylogeografie
- Disciplines (Ghent University):Ontologieën, datacuratie en text mining, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Systeembiologie niet elders geclassificeerd, Cel- en moleculaire biologie van planten, Single-cell data analyse, Analyse van next-generation sequence data, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie
Affiliaties
- Vandepoele Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2018 → Heden - De Veylder Lab (Onderzoeksgroep)
Lid
Vanaf1 jan 2017 → 31 dec 2017 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 dec 2000 → Heden
Infrastructuur
1 - 1 van 1
- ELIXIR België (Consortium partner)
Projecten
1 - 10 of 18
- De verborgen tuin: adaptatie en evolutie van diatomeeën in benthische habitatsVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Beoordeling van de rollen van endogene en omgevingsfactoren die de celgrootteverdeling en seksuele reproductie in benthische diatomeeënpopulaties regelenVanaf1 nov 2022 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Het in kaart brengen van functionele componenten van de diverse levenscycli in diatomeeën.Vanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele celVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Identificatie van het gen regulerende netwerken vasculaire ontwikkeling in planten - een vergelijkende benadering op single-cell resolutieVanaf1 okt 2021 → 14 okt 2022Financiering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Enzym biodiscovery-pijplijnoptimalisatie via toolbox-ontwikkelingVanaf1 sep 2021 → HedenFinanciering: VLAIO - Catalisti - cSBO
- Software ontwikkeling voor ontdekking en prioritizering van genen belangrijk voor plant-eigenschappen op basis van single-cell moleculaire profilering.Vanaf1 jun 2021 → 31 dec 2023Financiering: IOF - technologie validatie in labo
- Reproductieve barrières, interspecifieke gene flow en diversificatie in een wereldwijd voorkomende pennate diatomeeVanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Van modelsysteem tot gewas: een network-gebaseerde benadering voor het accuraat vertalen van biologische kennis in plantenVanaf1 okt 2019 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- ELIXIR Infrastructuur voor Data en Services om Life-Sciences Onderzoek in Vlaanderen te versterkenVanaf1 jan 2019 → 31 dec 2022Financiering: FWO Internationale onderzoeksinfrastructuur (IRI)
Publicaties
21 - 30 van 133
- Diurnal transcript profiling of the diatom Seminavis robusta reveals adaptations to a benthic lifestyle(2021)
Auteurs: Gust Bilcke, Cristina Maria Osuna Cruz, Marta Santana Silva, Nicole Poulsen, Sofie D'hondt, Petra Bulánková, Wim Vyverman, Lieven De Veylder, Klaas Vandepoele
Pagina's: 315 - 336 - TRAPID 2.0 : a web application for taxonomic and functional analysis of de novo transcriptomes(2021)
Auteurs: François Bucchini, Andrea Del Cortona, Lukasz Kreft, Alexander Botzki, Michiel Van Bel, Klaas Vandepoele
- Comment on U+2018Hayai-annotation plants : an ultrafast and comprehensive functional gene annotation system in plantsU+2019 : the importance of taking the GO graph structure into account(2021)
Auteurs: Michiel Van Bel, Klaas Vandepoele, Alfonso Valencia
Pagina's: 5558 - 5560 - Subfunctionalization of paralog transcription factors contributes to regulation of alkaloid pathway branch choice in Catharanthus roseus(2021)
Auteurs: Maite Colinas Martinez, Jacob Pollier, Dries Vaneechoutte, Deniz Malat, Fabian Schweizer, Liesbeth De Milde, Rebecca De Clercq, Joana G. Guedes, Teresa Martínez-Cortés, Francisco Hidalgo, et al.
- Light intensity and spectral composition drive reproductive success in the marine benthic diatom Seminavis robusta(2021)
Auteurs: Gust Bilcke, Lore Van Craenenbroeck, Alexandre Castagna Mourão e Lima, Cristina Maria Osuna Cruz, Klaas Vandepoele, Koen Sabbe, Lieven De Veylder, Wim Vyverman
- Canonical correlations reveal adaptive loci and phenotypic responses to climate in perennial ryegrass(2021)
Auteurs: José Luis BlancoU+2010Pastor, Philippe Barre, Thomas Keep, Thomas Ledauphin, Abraham EscobarU+2010Gutiérrez, Anna Maria Roschanski, Evelyn Willner, Klaus J. Dehmer, Matthew Hegarty, Hilde Muylle, et al.
Pagina's: 849 - 870 - A network-based comparative framework to study conservation and divergence of proteomes in plant phylogenies(2021)
Auteurs: Junha Shin, Harald Marx, Alicia Richards, Dries Vaneechoutte, Dhileepkumar Jayaraman, Junko Maeda, Sanhita Chakraborty, Michael Sussman, Klaas Vandepoele, Jean-Michel Ané, et al.
- Mating type specific transcriptomic response to sex inducing pheromone in the pennate diatom Seminavis robusta(2021)
Auteurs: Gust Bilcke, Koen Van den Berge, Sam De Decker, Nicole Poulsen, Petra Bulánková, Cristina Maria Osuna Cruz, Jack Dickenson, Koen Sabbe, Georg Pohnert, Klaas Vandepoele, et al.
Pagina's: 562 - 576 - Gene expression during bacterivorous growth of a widespread marine heterotrophic flagellate(2021)
Auteurs: Ramon Massana, Aurelie Labarre, David López-Escardó, Aleix Obiol, François Bucchini, Thomas Hackl, Matthias G. Fischer, Klaas Vandepoele, Denis V. Tikhonenkov, Filip Husnik, et al.
Pagina's: 154 - 167 - Integrative inference of transcriptional networks in Arabidopsis yields novel ROS signalling regulators(2021)
Auteurs: Inge De Clercq, Jan Van de Velde, Xiaopeng Luo, Li Liu, Veronique Storme, Michiel Van Bel, Robin Pottie, Dries Vaneechoutte, Frank Van Breusegem, Klaas Vandepoele
Pagina's: 500 - 513