Onderzoeker
Klaas Vandepoele
- Trefwoorden (Ghent University):systeembiologie, bioinformatica, Plantenbiotechnologie
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Celdood en senescentie, Invasiebiologie, Epigenomics, Auto-ecologie, Biogeografie en fylogeografie
- Disciplines (Ghent University):Ontologieën, datacuratie en text mining, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Systeembiologie niet elders geclassificeerd, Cel- en moleculaire biologie van planten, Single-cell data analyse, Analyse van next-generation sequence data, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie
Affiliaties
- Vandepoele Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2018 → Heden - De Veylder Lab (Onderzoeksgroep)
Lid
Vanaf1 jan 2017 → 31 dec 2017 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 dec 2000 → Heden
Infrastructuur
1 - 1 van 1
- ELIXIR België (Consortium partner)
Projecten
1 - 10 of 18
- De verborgen tuin: adaptatie en evolutie van diatomeeën in benthische habitatsVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Beoordeling van de rollen van endogene en omgevingsfactoren die de celgrootteverdeling en seksuele reproductie in benthische diatomeeënpopulaties regelenVanaf1 nov 2022 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Het in kaart brengen van functionele componenten van de diverse levenscycli in diatomeeën.Vanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele celVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Identificatie van het gen regulerende netwerken vasculaire ontwikkeling in planten - een vergelijkende benadering op single-cell resolutieVanaf1 okt 2021 → 14 okt 2022Financiering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Enzym biodiscovery-pijplijnoptimalisatie via toolbox-ontwikkelingVanaf1 sep 2021 → HedenFinanciering: VLAIO - Catalisti - cSBO
- Software ontwikkeling voor ontdekking en prioritizering van genen belangrijk voor plant-eigenschappen op basis van single-cell moleculaire profilering.Vanaf1 jun 2021 → 31 dec 2023Financiering: IOF - technologie validatie in labo
- Reproductieve barrières, interspecifieke gene flow en diversificatie in een wereldwijd voorkomende pennate diatomeeVanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Van modelsysteem tot gewas: een network-gebaseerde benadering voor het accuraat vertalen van biologische kennis in plantenVanaf1 okt 2019 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- ELIXIR Infrastructuur voor Data en Services om Life-Sciences Onderzoek in Vlaanderen te versterkenVanaf1 jan 2019 → 31 dec 2022Financiering: FWO Internationale onderzoeksinfrastructuur (IRI)
Publicaties
31 - 40 van 133
- MultiU+2010omics networkU+2010based functional annotation of unknown Arabidopsis genes(2021)
Auteurs: Thomas Depuydt, Klaas Vandepoele
Pagina's: 1193 - 1212 - Comprehensive and functional analysis of horizontal gene transfer events in diatoms(2020)
Auteurs: Emmelien Vancaester, Thomas Depuydt, Cristina Maria Osuna Cruz, Klaas Vandepoele
Pagina's: 3243 - 3257 - The medium-size noncoding RNA transcriptome of Ostreococcus tauri, the smallest living eukaryote, reveals a large family of small nucleolar RNAs displaying multiple genomic expression strategies(2020)
Auteurs: Laurie Bousquet, Claire Hemon, Paul Malburet, François Bucchini, Klaas Vandepoele, Nigel Grimsley, Herve Moreau, Manuel Echeverria
- Light regulation of LHCX genes in the benthic diatom Seminavis robusta(2020)
Auteurs: Lander Blommaert, Emmelien Vancaester, Marie Huysman, Cristina Maria Osuna Cruz, Sofie D'hondt, Johann Lavaud, Bernard Lepetit, Per Winge, Atle M. Bones, Klaas Vandepoele, et al.
- Comparative transcriptomics enables the identification of functional orthologous genes involved in early leaf growth(2020)
Auteurs: Jasmien Vercruysse, Michiel Van Bel, Cristina Maria Osuna Cruz, Shubhada Rajabhau Kulkarni, Véronique Van den Storme, Hilde Nelissen, Nathalie Gonzalez Sanchez, Dirk Inzé, Klaas Vandepoele
Pagina's: 553 - 567 - Identification and evolution of gene regulatory networks : insights from comparative studies in plants(2020)
Auteurs: Marc Jones, Klaas Vandepoele
Pagina's: 42 - 48 - Evolution of vascular plants through redeployment of ancient developmental regulators(2020)
Auteurs: Kuan-Ju Lu, Nicole van U+2019t Wout Hofland, Eliana Mor, Sumanth Mutte, Paul Abrahams, Hirotaka Kato, Klaas Vandepoele, Dolf Weijers, Bert De Rybel
Pagina's: 733 - 740 - The Seminavis robusta genome provides insights into the evolutionary adaptations of benthic diatoms (vol 11, 3320, 2020)(2020)
Auteurs: Cristina Maria Osuna Cruz, Gust Bilcke, Emmelien Vancaester, Sam De Decker, Atle M. Bones, Per Winge, Nicole Poulsen, Petra Bulánková, Bram Verhelst, Sien Audoor, et al.
- Inference of plant gene regulatory networks using data-driven methods : a practical overview(2020)
Auteurs: Shubhada Rajabhau Kulkarni, Klaas Vandepoele
- Distinctive growth and transcriptional changes of the diatom Seminavis robusta in response to quorum sensing related compounds(2020)
Auteurs: Frederike Stock genannt Schroer, Gust Bilcke, Sam De Decker, Cristina Maria Osuna Cruz, Koen Van den Berge, Emmelien Vancaester, Lieven De Veylder, Klaas Vandepoele, Wim Vyverman