Onderzoeker
Pieter Mestdagh
- Trefwoorden:RNA, kanker, Transcriptoomanalyse, niet-coderend RNA
- Disciplines:Analyse van next-generation sequence data, Kankerdiagnose, Kankertherapie, Moleculaire diagnostiek, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Computationele transcriptomics en epigenomics, Bio-informatica van ziekten, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Kankerbiologie, Transcriptie en translatie, Epigenetica, Genoomstructuur en -regulatie, Genetica
Affiliaties
- Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2006 → 30 sep 2018
Projecten
1 - 10 of 38
- Plasma cell vrij RNA biomerker tail genen voor screenen en opvolgen van kankerpatiëntenVanaf15 okt 2023 → HedenFinanciering: IOF - technologie concept exploratie
- Verhoging van de investeringswaarde van de IOF programma's CRISParray en Amalus: CRISPRi-gebaseerde opheldering van het moleculaire target van fibroblastmodulatorenVanaf15 jul 2023 → HedenFinanciering: IOF - technologie validatie in labo
- Integratie van moleculaire en cellulaire fenotypes: optimalisatie van RNA-seq en high content microscopy voor het CRISParray platformVanaf1 mei 2023 → HedenFinanciering: IOF - technologie concept exploratie
- Een nieuw foto-elektrochemisch singlet zuurstof gebaseerd detectieplatform voor een panel van kankerbiomerkers in weefsel- en vloeibare biopsieën (SOCAN)Vanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - iBOF
- Identificatie van lange niet-coderende RNAs die T-cell activatie modulerenVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Lange niet-coderende RNAs betrokken in de regulatie van tumor immunogeniciteitVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Incucyte S3: Uitgebreide cellulaire fenotypering met behulp van hoge doorvoer live-cel beeldvormingVanaf15 dec 2022 → HedenFinanciering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Functionele studie van een nieuwe, lange niet-coderende RNA (lncRNA) upstream van ABCA4 in de retina en in blindheidVanaf1 nov 2022 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- In kaart brengen en verstoren van interactie sites van het lange niet-coderende RNA NESPR in neuroblastoomVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - postdoctorale mandaten
- CRISParray: medicijnen sneller ontdekken door uitgebreide cellulaire en moleculaire fenotyperingVanaf1 aug 2022 → HedenFinanciering: IWT /VLAIO persoonsgebonden financ. - innovatiemandaten
Publicaties
31 - 40 van 261
- Substantial performance differences among RNA purification kits and blood collection tubes in the Extracellular RNA Quality Control (exRNAQC) study(2021)
Auteurs: Anneleen Decock, Olivier De Wever, Celine Everaert, Hetty Helsmoortel, An Hendrix, Pieter Mestdagh, Annelien Morlion, Jo Vandesompele, Ruben Van Paemel, Francisco Avila Cobos, et al.
Aantal pagina's: 1 - Checkpoint inhibition in combination with an immunoboost of external beam radiotherapy in solid tumors (CHEERS) : study protocol for a phase 2, open-label, randomized controlled trial(2021)
Auteurs: Mathieu Spaas, Nora Sundahl, Eva Hulstaert, Vibeke Kruse, Daan De Maeseneer, Annabel Meireson, Lieve Brochez, Dries Reynders, Els Goetghebeur, Robbe Van den Begin, et al.
- The RNA Atlas expands the catalog of human non-coding RNAs(2021)
Auteurs: Lucia Lorenzi, Hua-Sheng Chiu, Francisco Avila Cobos, Stephen Gross, Pieter-Jan Volders, Robrecht Cannoodt, Justine Nuytens, Katrien Vanderheyden, Jasper Anckaert, Steve Lefever, et al.
Pagina's: 1453 - 1465 - Substantial performance differences among RNA purification kits and blood collection tubes in the Extracellular RNA Quality Control study-important considerations for liquid biopsies(2020)Volume: 26
Auteurs: Anneleen Decock, Jasper Anckaert, Celine Everaert, Justine Nuytens, Scott Kuersten, An Hendrix, Jo Vandesompele, Pieter Mestdagh, Bert Dhondt, Ruben Van Paemel, et al.
Pagina's: 93 - 94 - SPECS: a non-parametric method to identify tissue-specific molecular features for unbalanced sample groups(2020)
Auteurs: Celine Everaert, Pieter-Jan Volders, Annelien Morlion, Olivier Thas, Pieter Mestdagh
- Benchmarking of cell type deconvolution pipelines for transcriptomics data(2020)
Auteurs: Francisco Avila Cobos, José Alquicira-Hernandez, Joseph E. Powell, Pieter Mestdagh
- The role of miR-155 in cigarette smoke-induced pulmonary inflammation and COPD(2020)
Auteurs: Hannelore Van Eeckhoutte, Francisco Avila Cobos, Fien Verhamme, Sharen Provoost, STIJN VERLEDEN, Pieter Mestdagh
Pagina's: 423 - 436 - Vapor nanobubble is the more reliable photothermal mechanism for inducing endosomal escape of siRNA without disturbing cell homeostasis(2020)
Auteurs: Juan Fraire, Gaëlle Houthaeve, Jing Liu, Laurens Raes, Lotte Vermeulen, Stephan Stremersch, Toon Brans, Gerardo Garcia-Diaz Barriga, Sarah De Keulenaer, Filip Van Nieuwerburgh, et al.
Pagina's: 262 - 275 - Performance assessment of total RNA sequencing of human biofluids and extracellular vesicles(2020)Volume: 26
Auteurs: Celine Everaert, Hetty Helsmoortel, Anneleen Decock, Eva Hulstaert, Ruben Van Paemel, Kimberly Verniers, Justine Nuytens, Jasper Anckaert, Nele Nijs, Joeri Tulkens, et al.
Pagina's: 94 - 95 - When DNA gets in the way : a cautionary note for DNA contamination in extracellular RNA-seq studies(2020)
Auteurs: Jasper Verwilt, Ruben Van Paemel, MD Giraldez, Pieter Mestdagh
Pagina's: 18934 - 18936
Patenten
1 - 9 van 9
- Inhibition of a lncRNA for treatment of neuroblastoma (Inventor)
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma (Inventor)
- Combinations of therapeutic agents for treating uveal melanoma (Inventor)
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma (Inventor)
- Usages of recombinant extracellular vesicles (Inventor)
- Inhibition of a lncRNA for treatment of neuroblastoma (Inventor)
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma (Inventor)
- Usages of recombinant extracellular vesicles (Inventor)
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma (Inventor)