Onderzoeker
Stein Aerts
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Adaptive agents en intelligente robotica
- Disciplines (KU Leuven):Andere biologische wetenschappen
- Zie ook: Stein Aerts (Vlaams Instituut voor Biotechnologie)
Affiliaties
- Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Verantwoordelijke
Vanaf1 okt 2009 → Heden - VIB Center for AI & Computational Biology (Onderzoekscentrum)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → Heden - C20 Support (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → 31 dec 2023 - Dynamische Systemen, Signaalverwerking en Gegevensanalyse (STADIUS) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 aug 2020 → 30 sep 2004 - Aerts Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2017 → Heden - Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 okt 2009 → Heden - Departement Menselijke Erfelijkheid (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2005 → 30 nov 2017
Projecten
1 - 10 of 66
- Genregulatie begrijpen in een heel dier: Van het bouwen van een regulatie-atlas tot het decoderen van genregulatie met deep learningVanaf10 jan 2024 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SpaceTimeOmics: combinatie van hogedoorvoer spatial omics met AI om generegulatie te modeleren in een organisme doorheen de tijdVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Interpretatie van genomische regulatorische variatie in de menselijke hersenen en de ziekte van Parkinson, door integratie van deep learning en single-cell multi-omicsVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Deep learning gebaseerd synthetisch ontwerp en massaal parallelle reporterassays om celtype- specifieke enhancer te karakteriseren en te benuttenVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Enhancer-AI: AI-gestuurde modellering en ontwerp van celtype-specifieke versterkers voor gentherapieVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategisch Basisonderzoek (SBO)
- Deep learning oplossingen voor het ontcijferen van genregulatie in het menselijk breinVanaf7 mrt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Toepassingen van deep learning voor kankergenomicaVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Evolutie van de genomische regulatorische code die ten grondslag ligt aan neuronale diversiteitVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SymBioSys: Analyse van de genomische heterogeneïteit via de computationele analyse van lange DNA fragmentenVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Ontrafelen van genregulatie Drosophila melanogaster: naar een regulatiemap in één-cel resolutieVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
Publicaties
1 - 10 van 122
- Cell-type-directed design of synthetic enhancers(2024)
Auteurs: Katina Spanier, Niklas Kempynck, Eren Can Eksi, Koen Theunis, Valerie Christiaens, David Mauduit, Stein Aerts
- Single-cell spatial multi-omics and deep learning dissect enhancer-driven gene regulatory networks in liver zonation(2024)
Auteurs: Valerie Christiaens, Jonas Demeulemeester, David Mauduit, Georg Halder, Stein Aerts
- SCENIC plus : single-cell multiomic inference of enhancers and gene regulatory networks(2023)
Auteurs: Seppe De Winter, Nikolai Hecker, Valerie Christiaens, Stein Aerts
Pagina's: 1355 - + - EXPLORING THE CODE OF LIFE: FROM DECODING TO DESIGNING CELL TYPE-SPECIFIC ENHANCERS WITH DEEP LEARNING(2023)
Auteurs: Ibrahim Ihsan Taskiran, Stein Aerts
- Neuronal identity defines a-synuclein and tau toxicity(2023)
Auteurs: Roman Praschberger, Natalie Kaempf, Eliana Nachman, Stein Aerts, Patrik Verstreken
- Shared enhancer gene regulatory networks between wound and oncogenic programs(2023)
Auteurs: Seppe De Winter, Georg Halder, Stein Aerts
- Emerging questions in transcriptional regulation(2023)
Auteurs: Stein Aerts
Pagina's: 247 - 251 - Reduced Levels of Misfolded and Aggregated Mutant p53 by Proteostatic Activation(2023)
Auteurs: Filip Claes, Rob van der Kant, Mark Fiers, Stein Aerts, Frederic Rousseau, Joost Schymkowitz, Frederik De Smet
- Mitochondria metabolism sets the species-specific tempo of neuronal development(2023)
Auteurs: Ryohei Iwata, Pierre Casimir, Emir Erkol, Sofie Beckers, Anke Vandekeere, Pieter Vermeersch, Sebastien Carpentier, Kristofer Davie, Max Mazzone, Stein Aerts, et al.
Pagina's: 553 - + - Reverse engineering cellular identity at single-cell resolution(2023)
Auteurs: Carmen Bravo González-Blas, Stein Aerts, Georg Halder