Onderzoeker
Stein Aerts
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Adaptive agents en intelligente robotica
- Disciplines (KU Leuven):Andere biologische wetenschappen
- Zie ook: Stein Aerts (Vlaams Instituut voor Biotechnologie)
Affiliaties
- Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Verantwoordelijke
Vanaf1 okt 2009 → Heden - VIB Center for AI & Computational Biology (Onderzoekscentrum)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → Heden - C20 Support (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → 31 dec 2023 - Dynamische Systemen, Signaalverwerking en Gegevensanalyse (STADIUS) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 aug 2020 → 30 sep 2004 - Aerts Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2017 → Heden - Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 okt 2009 → Heden - Departement Menselijke Erfelijkheid (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2005 → 30 nov 2017
Projecten
1 - 10 of 66
- Genregulatie begrijpen in een heel dier: Van het bouwen van een regulatie-atlas tot het decoderen van genregulatie met deep learningVanaf10 jan 2024 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SpaceTimeOmics: combinatie van hogedoorvoer spatial omics met AI om generegulatie te modeleren in een organisme doorheen de tijdVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Interpretatie van genomische regulatorische variatie in de menselijke hersenen en de ziekte van Parkinson, door integratie van deep learning en single-cell multi-omicsVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Deep learning gebaseerd synthetisch ontwerp en massaal parallelle reporterassays om celtype- specifieke enhancer te karakteriseren en te benuttenVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Enhancer-AI: AI-gestuurde modellering en ontwerp van celtype-specifieke versterkers voor gentherapieVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategisch Basisonderzoek (SBO)
- Deep learning oplossingen voor het ontcijferen van genregulatie in het menselijk breinVanaf7 mrt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Toepassingen van deep learning voor kankergenomicaVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Evolutie van de genomische regulatorische code die ten grondslag ligt aan neuronale diversiteitVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SymBioSys: Analyse van de genomische heterogeneïteit via de computationele analyse van lange DNA fragmentenVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Ontrafelen van genregulatie Drosophila melanogaster: naar een regulatiemap in één-cel resolutieVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
Publicaties
11 - 20 van 123
- Reverse engineering cellular identity at single-cell resolution(2023)
Auteurs: Carmen Bravo González-Blas, Stein Aerts, Georg Halder
- Decoding gene regulation in the fly brain(2022)
Auteurs: Jasper Janssens, Stein Aerts, Jeroen Lammertyn
- Cell type diversity in a developing octopus brain(2022)
Auteurs: Ruth Styfhals, Katina Spanier, Ali Murat ELAGOZ, Seppe De Winter, Astrid Deryckere, Stein Aerts, Eve Seuntjens
- Hippo signaling instructs ectopic but not normal organ growth(2022)
Auteurs: Weronika Kowalczyk, Hanne Hillen, Jun Xie, Soheil Soheily, Ivan Moya, Stein Aerts, Georg Halder
Pagina's: 744 - + - A real-world single-centre analysis of the safety and efficacy of cladribine tablets for relapsing multiple sclerosis(2022)
Auteurs: Stein Aerts
Pagina's: 892 - 892 - How regulatory sequences learn cell representations New computational method uses convolutional neural networks for cis-regulatory sequence analysis to analyze and cluster scATAC-seq data(2022)
Auteurs: Stein Aerts
Pagina's: 1041 - 1043 - Of Men and Water Fleas: Gene regulatory network discovery in human cancer and in an ecological context(2022)
Auteurs: Katina Spanier, Luc De Meester, Stein Aerts, Luisa Orsini
- Fly Cell Atlas: A single-nucleus transcriptomic atlas of the adult fruit fly(2022)
Auteurs: Jasper Janssens, Kristofer Davie, Stein Aerts
Pagina's: 991 - + - Hydrop enables droplet-based single-cell ATAC-seq and single-cell RNA-seq using dissolvable hydrogel beads(2022)
Auteurs: Florian De Rop, Jasper Janssens, Koen Theunis, Valerie Christiaens, Jasper Wouters, Gabriele Marcassa, Joris de Wit, Stein Aerts
- Comparative analysis of antibody- and lipid-based multiplexing methods for single-cell RNA-seq(2022)
Auteurs: Isabelle Scheyltjens, Stein Aerts