Onderzoeker
Stein Aerts
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Adaptive agents en intelligente robotica
- Disciplines (KU Leuven):Andere biologische wetenschappen
- Zie ook: Stein Aerts (Vlaams Instituut voor Biotechnologie)
Affiliaties
- Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Verantwoordelijke
Vanaf1 okt 2009 → Heden - VIB Center for AI & Computational Biology (Onderzoekscentrum)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → Heden - C20 Support (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → 31 dec 2023 - Dynamische Systemen, Signaalverwerking en Gegevensanalyse (STADIUS) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 aug 2020 → 30 sep 2004 - Aerts Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2017 → Heden - Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 okt 2009 → Heden - Departement Menselijke Erfelijkheid (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2005 → 30 nov 2017
Projecten
1 - 10 of 66
- Genregulatie begrijpen in een heel dier: Van het bouwen van een regulatie-atlas tot het decoderen van genregulatie met deep learningVanaf10 jan 2024 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SpaceTimeOmics: combinatie van hogedoorvoer spatial omics met AI om generegulatie te modeleren in een organisme doorheen de tijdVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Interpretatie van genomische regulatorische variatie in de menselijke hersenen en de ziekte van Parkinson, door integratie van deep learning en single-cell multi-omicsVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Deep learning gebaseerd synthetisch ontwerp en massaal parallelle reporterassays om celtype- specifieke enhancer te karakteriseren en te benuttenVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Enhancer-AI: AI-gestuurde modellering en ontwerp van celtype-specifieke versterkers voor gentherapieVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategisch Basisonderzoek (SBO)
- Deep learning oplossingen voor het ontcijferen van genregulatie in het menselijk breinVanaf7 mrt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Toepassingen van deep learning voor kankergenomicaVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Evolutie van de genomische regulatorische code die ten grondslag ligt aan neuronale diversiteitVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SymBioSys: Analyse van de genomische heterogeneïteit via de computationele analyse van lange DNA fragmentenVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Ontrafelen van genregulatie Drosophila melanogaster: naar een regulatiemap in één-cel resolutieVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
Publicaties
21 - 30 van 123
- Decoding gene regulation in the fly brain(2022)
Auteurs: Jasper Janssens, Ibrahim Ihsan Taskiran, Katina Spanier, Florian De Rop, Valerie Christiaens, Stein Aerts
Pagina's: 630 - + - Analysis of long and short enhancers in melanoma cell states(2021)
Auteurs: David Mauduit, Ibrahim Ihsan Taskiran, Jonas Demeulemeester, Jasper Wouters, Stein Aerts
- Tyrosine-Dependent Phenotype Switching Occurs Early in Many Primary Melanoma Cultures Limiting Their Translational Value(2021)
Auteurs: Jasper Wouters, Stein Aerts, Chris Marine
- 14q32 rearrangements deregulating BCL11B mark a distinct subgroup of T-lymphoid and myeloid immature acute leukemia(2021)
Auteurs: Kim De Keersmaecker, Peter Vandenberghe, Stein Aerts, Jan Cools
Pagina's: 773 - 784 - TECHNOLOGICAL AND COMPUTATIONAL ADVANCEMENTS IN DROSOPHILA SINGLE-CELL OMICS(2021)
Auteurs: Kristofer Davie, Stein Aerts
- Interpretation of allele-specific chromatin accessibility using cell state-aware deep learning(2021)
Auteurs: Ibrahim Ihsan Taskiran, Jonas Demeulemeester, David Mauduit, Valerie Christiaens, Jasper Wouters, Stein Aerts
- Actuation enhances patterning in human neural tube organoids(2021)
Auteurs: Gregorius Andika Rustandi, Benjamin Gorissen, Kristofer Davie, Catherine Verfaillie, Maurilio Sampaolesi, Peter Dedecker, Hans Van Oosterwyck, Stein Aerts, Adrian Ranga
- Integrating genetic, environmental and developmental variation to study gene regulatory mechanisms(2021)
Auteurs: Olga Sigalova, Stein Aerts
- Chromatin accessibility profiling methods(2021)
Auteurs: Stein Aerts
- Cross-species analysis of enhancer logic using deep learning(2020)
Auteurs: Liesbeth Minnoye, Ibrahim Ihsan Taskiran, David Mauduit, Linde Van Aerschot, Panagiotis Karras, Chris Marine, Jasper Wouters, Stein Aerts