Onderzoeker
Stein Aerts
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Adaptive agents en intelligente robotica
- Disciplines (KU Leuven):Andere biologische wetenschappen
- Zie ook: Stein Aerts (Vlaams Instituut voor Biotechnologie)
Affiliaties
- Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Verantwoordelijke
Vanaf1 okt 2009 → Heden - VIB Center for AI & Computational Biology (Onderzoekscentrum)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → Heden - C20 Support (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → 31 dec 2023 - Dynamische Systemen, Signaalverwerking en Gegevensanalyse (STADIUS) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 aug 2020 → 30 sep 2004 - Aerts Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2017 → Heden - Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 okt 2009 → Heden - Departement Menselijke Erfelijkheid (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2005 → 30 nov 2017
Projecten
11 - 20 of 66
- Ontcijferen van gen-regulatorische netwerken in de era van single-cell multi-omicsVanaf1 sep 2022 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Modellering van genregulatie met end-to-end deep learning van genexpressie-voorspellingenVanaf1 sep 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Integratie van lange read en unieke cell multi-omics sequenering voor de identificatie van genetische variatie in de ziekte van ParkinsonVanaf1 sep 2022 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Rebus EsperVanaf29 jun 2022 → HedenFinanciering: Andere fed. wetenschappelijke instellingen.
- Geavanceerde infrastructuur voor de fabricage van de volgende generatie micro- and nanosystemenVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Het decoderen van de impact van intercellulaire communicatie op de identiteit van tumortoestanden bij epitheliale kankersVanaf1 jan 2022 → HedenFinanciering: FWO EOS
- Het ontrafelen van de regulerende code die de vorming van neurale circuits dirigeertVanaf5 okt 2021 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Single-cell deep learning en comparatieve genoomanalyse voor het in kaart brengen van genregulatorische netwerken en enhancerstructurenVanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: FWO senior postdoctoraal mandaat
- OncoAI - een machine-learning raamwerk om de kwetsbaarheid van kankercellen op genregulerend niveau te voorspellenVanaf1 mrt 2021 → HedenFinanciering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Constructie van een gen-regulatorische Fly Cell Atlas met behulp van single-cell multi-omics en deep learningVanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
Publicaties
1 - 10 van 122
- Cell-type-directed design of synthetic enhancers(2024)
Auteurs: Katina Spanier, Niklas Kempynck, Eren Can Eksi, Koen Theunis, Valerie Christiaens, David Mauduit, Stein Aerts
- Single-cell spatial multi-omics and deep learning dissect enhancer-driven gene regulatory networks in liver zonation(2024)
Auteurs: Valerie Christiaens, Jonas Demeulemeester, David Mauduit, Georg Halder, Stein Aerts
- SCENIC plus : single-cell multiomic inference of enhancers and gene regulatory networks(2023)
Auteurs: Seppe De Winter, Nikolai Hecker, Valerie Christiaens, Stein Aerts
Pagina's: 1355 - + - EXPLORING THE CODE OF LIFE: FROM DECODING TO DESIGNING CELL TYPE-SPECIFIC ENHANCERS WITH DEEP LEARNING(2023)
Auteurs: Ibrahim Ihsan Taskiran, Stein Aerts
- Neuronal identity defines a-synuclein and tau toxicity(2023)
Auteurs: Roman Praschberger, Natalie Kaempf, Eliana Nachman, Stein Aerts, Patrik Verstreken
- Shared enhancer gene regulatory networks between wound and oncogenic programs(2023)
Auteurs: Seppe De Winter, Georg Halder, Stein Aerts
- Emerging questions in transcriptional regulation(2023)
Auteurs: Stein Aerts
Pagina's: 247 - 251 - Reduced Levels of Misfolded and Aggregated Mutant p53 by Proteostatic Activation(2023)
Auteurs: Filip Claes, Rob van der Kant, Mark Fiers, Stein Aerts, Frederic Rousseau, Joost Schymkowitz, Frederik De Smet
- Mitochondria metabolism sets the species-specific tempo of neuronal development(2023)
Auteurs: Ryohei Iwata, Pierre Casimir, Emir Erkol, Sofie Beckers, Anke Vandekeere, Pieter Vermeersch, Sebastien Carpentier, Kristofer Davie, Max Mazzone, Stein Aerts, et al.
Pagina's: 553 - + - Reverse engineering cellular identity at single-cell resolution(2023)
Auteurs: Carmen Bravo González-Blas, Stein Aerts, Georg Halder