Antibioticum tolerantie in Escherichia coli: functionele karakterisatie en single-cell analyse van stochastische genexpressie van een nieuw persistentiegen.

Persistentie is het fenomeen waarbij een fractie van een isogene bacteriële populatie weerstandig is tegen extreem hoge dosissen van antibiotica. Deze persistorfractie wordt verantwoordelijk geacht voor het heropflakkeren van infecties na een antibioticumbehandeling. Niettegenstaande dit fenomeen reeds meer dan 60 jaar geleden voor het eerst werd beschreven, blijft de oorzaak van persistentie onduidelijk. Dit heeft het ontwikkelen van specifieke therapieën gericht tegen persistorcellen tot nog toe onmogelijk gemaakt. Recent identificeerden we een belangrijke regulator van persistentie in Escherichia coli. Dit onderzoeksvoorstel beschrijft de functionele karakterisering van dit eiwit en gaat na hoe stochastische variaties in genexpressie aanleiding geven tot fenotypische heterogeniteit binnen een isogene populatie. Daarnaast zal onderzocht worden in welke mate de rol van dit eiwit in persistentie geconserveerd is in andere klinisch relevante bacteriën. Hiertoe zal een combinatie van state-of-the-art moleculair microbiologische, microscopische en statistische analysetechnieken aangewend worden. De resultaten die zullen voortvloeien uit dit onderzoek moeten op termijn bijdragen aan het ontwikkelen van betere therapieën om infectieziekten te behandelen.

Trefwoorden:Stochastic gene expression, Escherichia coli, Antibiotic tolerance, Persistence

Disciplines:Microbiologie, Systeembiologie, Laboratoriumgeneeskunde, Biochemie en metabolisme, Medische biochemie en metabolisme, Engineering van biomaterialen, Biologische systeemtechnologie, Biomateriaal engineering, Biomechanische ingenieurswetenschappen, Andere (bio)medische ingenieurswetenschappen, Milieu ingenieurswetenschappen en biotechnologie, Industriële biotechnologie, Andere biotechnologie, bio-en biosysteem ingenieurswetenschappen