De vroege embryonale functie van TET DNA-dioxygenases bij menselijke neurulatie en ziekte

TET-enzymen verwijderen DNA-methylatie. Voorafgaand aan de activatie van neuronale genen, leidt verlies van Tet1 in het pre-gastrulatie epiblast tot ontregeling van hun chromatine toegankelijkheid en DNA-methylatie, wat leidt tot pre- en postnatale neurologische ontwikkelingsstoornissen. In dit project vertalen we deze resultaten van muis naar mens met in vitro differentiatie van humane embryonale stamcellen tot neuronale voorlopers en 3D organoïden. In deze culturen zullen we de veranderingen in gen expressie, chromatine toegankelijkheid, en DNA methylatie onderzoeken en zullen we hun afhankelijkheid van TET en co-factoren bepalen. Met high-throughput sequencing zullen we ontdekken hoe in het vroege leven downstream van TET of co-factor-deficiëntie, ziekte-gerelateerde genetische varianties of epigenetische ontregeling gerelateerd aan non-genetische factoren, of beide, de balans tussen ziekte en gezondheid wordt bepaald.

Trefwoorden:Neurulation, Epigenetics, Chromatin accessibility, DNA methylation, Cell fate, Embryonic stem cells

Disciplines:Stamcelbiologie, Ontwikkelingsbiologie, Ontwikkelingsneurowetenschappen, Epigenetica