Engineering van Pseudomonas aeruginosa naar de ontwikkeling van minimale faaggenomen

Bacteriofagen, of fagen, zijn bacteriële virussen die algemeen worden erkend als mogelijke therapeutische werktuigen tegen bacteriën. Hoewel faaggenomen relatief klein zijn, is de functie van de meeste open leesramen nog onbekend. Bovendien is de huidige kennis over de interactie tussen fagen en hun bacteriële gastheren, in het bijzonder de globale invloed van faaginfectie op transcriptoom van gastheerbacteriën, nog steeds erg beperkt. Omdat Pseudomonas aeruginosa een van de meest relevante opportunistische pathogenen is, zal de interactie tussen P. aeruginosa-fagen en hun gastheren in verschillende stadia van faaginfectie worden bestudeerd. Dit zal de identificatie mogelijk maken van de genen van fagen tot expressie gebracht tijdens bacteriële infecties, beter begrijpen hoe bacteriën hun transcriptoom aanpassen in reactie op faaginfectie en of faag niet-essentiële genen draagt die mogelijk kunnen worden verwijderd. Met behulp van faag-engineering tools zullen P. aeruginosa fagen genetisch gemanipuleerd worden om kleinere en veiligere genomen te bereiken, zonder genen die onbekende functies coderen.