Nauwkeurigere detectie van biomerkers predictief voor kanker immuuntherapie respons met een Nanopore Long-read- gebasseerde sequencing technologie

De laatste jaren heeft immunotherapie (met name de immuun checkpoint inhibitoren) een opmerkelijk klinisch succes geboekt voor de behandeling van verschillende kankertypes. Genetische schade, de expressie van retrovirale elementen die zich in ons DNA inegreerden en het aantal cytotoxische T cellen in de tumor zijn mechanismen die aan de basis om het immuunsysteem de kanker te laten herkennen en af te breken.  Om deze echter aan te wenden als betrouwbare biomerkers en de werking van immuuntherapie correct te voorspellen zijn enkele belangrijke technische verbeteringen nodig om deze parameters te detecteren. In deze aanvraag zullen we de allereerste derde-generatie nanopore sequencing technologie gebruiken en de mogelijkheid die deze veelbelovende technologie biedt nagaan om biomerkers voor immuuntherapie response te detecteren én valideren.