< Terug naar vorige pagina

Project

STRESSFLEA-B: Hoe leven in een mozaïek van stressoren - een ecologische genomica benadering bij de watervlo Daphnia.

In dit project beogen we de analyse van genetische response op meerdere stressoren in natuurlijke populaties, gebruik makende van een ecologische genomica benadering bij het modelsysteem Daphnia (de watervlo). We zullen een genoom-scan benadering toepassen om genoomregios te koppelen aan orthogonale selectiegradiënten in de natuur, met zowel natuurlijke (vispredatie, parasitisme) als door de mens veroorzaakte (intensief landgebruik) stressoren. We zullen vervolgens populaties onderzoeken voor variatie in kandidaatgenen die werden geïdentificeerd op basis van de resultaten van de genoom-scan benadering en transcriptoomanalyse. Ons doel is de genomische onderbouw van evolutionaire responsen in de natuur te ontrafelen, gebruik makende van de snel groeiende genoominformatie bij Daphnia. We zullen ook een gerichte methyloomanalyse uitvoeren om de relatie tussen responsen op selectie, maternal effecten en epigenetica te onderzoeken. Belangrijke vernieuwende bijdragen zijn onder meer de aandacht voor combinaties van stressoren alsook voor de analyse van natuurlijke populaties. Het project zal sterk voordeel halen uit haar inbedding in het internationale STRESSFLEA consortium en zal sterk bijdragen tot de ontwikkeling van Daphnia als een belangrijk modelsysteem in omgevingsgenomica.
Datum:1 jan 2011 →  31 dec 2014
Trefwoorden:Daphnia, Methylation, Candidate genes, Genome scans, Environmental genomics, Multiple stressors, Ecological genomics
Disciplines:Dierkundige biologie, Geologie, Aquatische wetenschappen, uitdagingen en vervuiling