Studie van de rol van SOX11 in het adrenerge celtype van neuroblastoom als stap op weg naar celprecisie geneeskunde

Neuroblastoom (NB) is een pediatrische tumor die ontstaat uit het perifere zenuwstelsel. Ondanks intensieve therapie overleeft momenteel slechts de helft van de hoog-risicopatiënten. Recente data tonen twee verschillende subpopulaties in neuroblastoomtumoren: de zognaamde "adrenerge" (ADRN) cellen en "mesenchymale" (NCC/MES) cellen, waarbij deze laatste meer chemo-tolerant zijn en vooral voorkomen in tumoren na herval. Onlangs hebben we de betrokkenheid van de neuronale en ADRN specifieke transcriptiefactor SOX11 geïdentificeerd bij NB-ontwikkeling. In dit onderzoeksproject zal ik de vermoedelijke oncogene rol van SOX11 verder ontrafelen als de belangrijkste regulator van chromatinevorming en MYCN-gereguleerde ontwikkelingsprogramma's. Hiervoor zal ik (single-cell) -RNA-seq, ATAC-seq en ChIP-seq data combineren na SOX11 en/of MYCN-depletie in NB cellen (in vitro) en overexpressie in muizen en/of zebravistumoren (in vivo). Ik zal SOX11 expressie in NCC/MES en ADRN celtypes moduleren om transitie tussen deze twee subtypes te onderzoeken en deze celtypes op eencellig niveau in detail te karakteriseren. In een laatste stap zal ik combinaties van geneesmiddelen zoeken en evalueren om zowel de ADRN als de NES/MES celtypes van NB-tumoren te kunnen behandelen en zo chemo-tolerante subpopulaties uit te schakelen. Dit project kan aldus de basis vormen voor het verkennen van de toepassing van een nieuw therapeutisch concept genaamd "cell precision medicine".