Titel Promotor Affiliaties "Korte inhoud" "Een diagnostische test voor cochleaire synaptopathie bij mensen" "Sarah Verhulst, Ingeborg Dhooge" "Vakgroep Informatietechnologie, Vakgroep Hoofd en Huid" "De CochSyn-test is bedoeld om de eerste tekenen van blijvende gehoorschade te diagnosticeren met een 10-15 minuten durende klinische gehoorscreeningstest. De test kwantificeert cochleaire synaptopathie, d.w.z. schade aan de synapsen van de cochleaire gehoorzenuwvezels als gevolg van veroudering, blootstelling aan lawaai of ototoxiciteit, met een niet-invasieve auditieve EEG-test. Omdat synaptopathie gepaard gaat met verminderde spraakverstaanbaarheid en optreedt voordat het audiogram tekenen van gehoorbeschadiging vertoont, is onze test gevoeliger dan het audiogram (huidige klinische standaard) en kan een wijdverspreide vorm van perceptief gehoorverlies kwantificeren. De CochSyn-test maakt vroege diagnose en vroege interventie mogelijk, wat volgens de WHO kosteneffectief is bij het verminderen van de financiële last die gepaard gaat met onbehandeld gehoorverlies. In dit PoC-project zijn we van plan de CochSyn-test te verfijnen en een normatieve dataset van testresultaten (N=300) op te bouwen voor een diverse populatie van mensen die risico lopen op synaptopathie. Deze dataset is nodig om (i) het toepassingsgebied van de test te bepalen en een precieze diagnostische interpretatie mogelijk te maken, (ii) KNO-artsen te overtuigen om de test te gebruiken en bedrijven om erin te investeren, en (iii) gezondheidsinstanties en beleidsmakers te overtuigen dat synaptopathie een belangrijk gezondheidsrisico vormt, gezien de impact ervan op de verslechterende spraakverstaanbaarheid in rumoerige luisteromgevingen." "QBOL: Ontwikkeling van een nieuwe diagnostische tool, gebruikmakend van DNA bar codering voor de identificatie van quarantaine organismen ter ondersteuning van duurzame planten groei" "Paul De Vos" "Vakgroep Biochemie en Microbiologie" "Ons deel van het project beoogt: - het genereren van relevante, kwaliteitsvolle DNA sequentie data (core genes and accessory genes) voor Clavibacter michiganensis pv. In een taxonomisch correcte context. - Een diagnostische tool te ontwikkelen voor Clavibacter quarantaine vertegenwoordigers, gebaseerd op deze DNA bar codering - Ontwikkelen van strategische methoden om DNA databanken te installeren van representatieve quarantaine organismen (Clavibacter) en deze toegankelijk te maken via elektronische bevraging - Verbeteren en stimuleren van samenwerking tussen EU diagnostische laboratoria en laboratoria uit derde wereld landen in de context van het project." "Gedecentraliseerde microfluïdische in vitro diagnostische patch voor pandemische controle" "Jeroen Lammertyn" "Mechatronica, Biostatistiek en Sensoren (MeBioS), Faculteit Economie en Bedrijfswetenschappen, Campus Kulak Kortrijk" "In vitro diagnostic (IVD) technologies have revolutionized healthcare, yet remain confined to the laboratories. This traditional approach massively failed to manage viral outbreak during the COVID-19 pandemic because it lacked quick and cost-effective diagnosis. Moreover, an urgent need was evident for bringing quantitative lab-quality diagnosis to the hands of end users (i.e. point-of-care, POC). Despite high expectations from Lab-on-Chip technologies, they failed so far to disrupt the IVD market due to their complexity, high cost, off-chip sample preparation, poor scalability, to mention a few. The DECIPHER consortium aims to revolutionize the POC IVD field by developing innovative microfluidic-based DECIPHER patch capable of both biofluids (self-)sampling via hollow microneedles (HMNs) and immediate analysis of this sample on the very same patch in a completely self-powered manner, producing quantitative result to be read out with a re-purposed glucose meter. Ebola and Lassa viruses are selected as relevant model systems because they are highly contagious with human-to-human transmission, high mortality rate and no vaccine/treatment available, thus having meaningful potential for new pandemic threats. To offer such a genuine sample-to-result quantitative POC solution, the DECIPHER value chain, from lab to market, will cover: (1) investigation of high-throughput manufacturing processes with (2) novel polymers, innovations in the fields of (3) microfluidics, (4) HMNs and (5) quantitative molecular bioassays, (6) DECIPHER patch analytical and clinical validation (both retrospective and prospective), as well as (7) AI-based models, (8) socio-economic/systems analysis and (9) life cycle assessment of DECIPHER patch. This true interdisciplinarity will be represented by highly experienced DECIPHER consortium with partners from 3 universities, 5 research institutes, 1 SME, 1 large company and 1 non-governmental organization from 6 countries." "Een geïntegreerd platform voor het ontwikkelen van diagnostische technieken voor hersenkanker" "Jeroen Lammertyn" "Mechatronica, Biostatistiek en Sensoren (MeBioS)" "The mission of AiPBAND is to train a new generation of entrepreneurial and innovative early-stage researchers (ESRs) in the early diagnosis of brain tumours using molecular biomarkers in the blood, meeting the medical and societal challenges of this emerging field. AiPBAND will focus on gliomas, a range of devastating and progressive brain tumours affecting around 25,000 people each year in Europe and responsible for the majority of deaths from primary brain tumours.Fourteen fellows will be trained by experts in 9 academic and 3 non-academic beneficiaries, belonging to 5 EU member states and 6 partner organizations (4 private sectors and 2 international academic), with fields ranging from neuroscience, engineering (including big data science), healthcare to economics. State-of-the-art technologies will be applied in parallel to:identify novel blood biomarkers from patients with gliomasdesign three types of multiplex biosensor (plasmonic-based, graphene-based, and digital ELISA assay-based)develop a big data-empowered intelligent data management infrastructure, and (iv) develop cloud-based diagnostic systems.Proof-of-concept will be evaluated through clinical trials to assess accuracy, sensitivity and specificity. The elaborately designed individual research projects under the Vitae Researcher Development Framework – carefully arranged into local training courses, network wide events, secondments, personalized career development plans, with strong involvement of the private sector – will ensure exploitation of AiPBAND's achievements, and will maximize the ESRs’ abilities in creative & innovative thinking, triple-i knowledge transformation, and encourage a business-orientated mind-set and entrepreneurship." "Nieuwe diagnostische tools voor infectieziektes (ND4ID)" "Herman Goossens" "Laboratorium voor Medische Microbiologie (LMM), Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)" "Infectieziektes zijn een belangrijke last voor de publieke gezonheid en globale economie, vooral door de antimicrobiele resistentie. Snelle point-of-care (POC) in vitro diagnostiek bepalingen (IVD) zijn essentiële middelen voor effectief klinisch management van patiënten met infectieziektes. Nochtans is er nog steeds een grote niet-beantwoorde klinische nood aan snellere POC IVDs die meer klinisch relevante, actie-gerichte informatie genereren. Op een efficiënte manier deze nood beantwoorden vraagt een verandering in de huidige benadering van opleiding van onderzoekers in IVDs, om zo een nieuwe groep onderzoekers te creëren die in staat zijn de kloof te dichten tussen klinisch en technologisch perspectief. ND4ID neemt deze uitdaging aan door 15 jonge onderzoekers een uniek, van wereldklasse trainingsprogramma aan te reiken waarbij ze in aanraking zullen komen met de volledige breedte van disciplines vanuit klinisch, technologisch en markt-gericht oogpunt van zowel de academische als niet-academische sector. Door een aantal synergistische onderzoeksprojecten rond nieuwe POC assays gericht op de belangrijkste en dringendste klinische noden bij wereldspelers van academische en private onderzoeksgroepen wordt aan de ESRs een holistisch trainingsprogramma aangeboden dat hen voorbereidt om leiders te worden in het toekomstige IVD veld. Deze opleiding door onderzoek wordt ondersteund door een uniek, netwerk-omvattend trainingsprogramma die klinische, technische and translationele kennis combineert met relevante ervaring in IVD onderzoek, ontwikkeling en exploitatie. Op deze manier zal ND4ID ESRs aanleveren die hoog bevraagd zullen zijn, en een voorbeeldfunctie zullen uitoefenenen voor andere academische en niet-academische spelers betrokken bij de opleiding van IVD onderzoekers, en zal Europa's positie in het competitieve veld van IVD technologie verder versterkt worden." "Een beslissingsondersteuningsysteem dat een gevalideerde patientspecifieke, multischaal evenwichthypermodel voor vroegtijdige uitwerking van diagnostische evaluatie en efficiënte management plannen voor evenwichtsstoornissen (EMBalance)." "Floris Wuyts" "Labo voor evenwichtsonderzoek en aerospace (LEIA)" "Dit project kadert in een onderzoeksopdracht tussen enerzijds UA en anderzijds EU. UA levert aan EU de onderzoeksresultaten genoemd in de titel van het project onder de voorwaarden zoals vastgelegd in voorliggend contract." "Introductie van diagnostische toepassingen van '3Gb-testen' in de menselijke genetica" "Gert Matthijs" "Departement Menselijke Erfelijkheid" "The landscape of genetic testing is rapidly changing. Soon, whole genome sequence analysis (3Gb-testing) will be an effective and financially viable alternative to targeted gene analysis. New technologies that allow efficient sequencing of a whole human genome in a diagnostic setting will have an enormous impact on diagnostic centres replacing many existing molecular and cytogenetic tests.Patients deserve to benefit from our vastly growing knowledge on functional genomics. 3Gb-testing is the ideal method to bring these benefits to the public. However, it is critical to avoid mistakes with respect to ethics, quality, over or mis-interpretation of data. It is essential that our society is prepared for the change once it is implemented. Hence, current gaps in our knowledge have to be identified and research has to be initiated to bridge these gaps. The 3Gb-TEST project will bring stakeholders together and ensure they are informed with respect to the desirable and undesirable developments.The clinical utility and cost effectiveness of whole genome sequencing needs to be determined as part of a robust health technology assessment process (HTA). Interpretation of sequence data in terms of clinical relevance will pose a challenge to both laboratory and clinical geneticists. Substantial investments may be required and the logistic restructuring of genetic services will need to be addressed.This project aims to prepare Europe for innovations in molecular testing. Quality assessment schemes, HTA and guidelines have to be in place. Healthcare professionals must be aware of the impending change and potential impact on practice. The Consortium will inform the healthcare community and make recommendations to the European Commission, the European Society of Human Genetics, and national organizations relevant to this field. A key output will be a validated roadmap for the implementation of diagnostic genome sequencing in Europe." "Ontwikkeling van een 'Rapid Point-of-Care testplatform' voor infectieziekten (RAPP-ID)." "Herman Goossens" "Instituut voor Vaccin-en Infectieziekten (VAXINFECTIO)" "RAPP-ID is een 5 jaar durend Europees project met 10 academische en 9 industriële partners (4 KMO's en 5 grote farmaceutische ondernemingen) dat ondersteund wordt door de Europese Commissie via IMI-JU financiering. Dit project heeft als doel een testplatform te ontwikkelen dat een snelle diagnose van de aanwezigheid en de oorzaak van een bacteriële, virale of fungale infectie kan bewerkstelligen. Bovendien zal bijkomende informatie worden bekomen over de resistentie tegen antibiotica in geval van een bacteriële infectie. In tegenstelling tot de huidige diagnostische testen, die enkele dagen kunnen duren, zal een snelle diagnostische test (in de ziekenhuissetting binnen de 2 uur en bij de huisarts binnen een half uur) leiden tot een gerichte behandeling en correcter gebruik van antibiotica. Hiertoe worden binnen RAPP-ID de modernste biotechnologische en biochemische technieken gecombineerd met ultragevoelige detectie-technologieën. RAPP-ID focust op bloedstroominfecties, lage luchtweginfecties en tuberculose." "Van Omics tot patiënt: Verbetering diagnostiek van pathogene gisten" "Mario Vaneechoutte" "Vakgroep Diagnostische Wetenschappen, Vakgroep Klinische Biologie, Microbiologie en Immunologie, University of Aberdeen, Innsbruck Medical University, Hans Knöll Institute, University College Dublin, Centre for Genomic Regulation, Royal Netherlands Academy of Arts and Sciences, Bruker (Germany)" "  Opathie (van Omics van PATHogenics gist) is een innovatief translationeel onderzoek training netwerk dat het potentieel van de volgende generatie high-throughput technologieën, waaronder genomics, transcriptomics en proteomics zal onderzoeken, om de interacties van gisten die ziekten bij de mens veroorzaken studeren (bv Candida en Cryptococcus sp.) met hun gastheer, en om nieuwe diagnostische hulpmiddelen om schimmelinfecties in de kliniek te controleren ontwikkelen." "Geïntegreerde siliciumfotonica voor monitoring van cardiovasculaire aandoeningen" "Patrick Segers" "Vakgroep Elektronica en Informatiesystemen, Imec, Inserm, Maastricht University, FUNDICO BVBA, Polytechnic University of Turin, Medtronic (Netherlands), University College Cork, ARGOTECH AS" "De reden voor Medtronic en partners om het InSiDe-project voor te stellen, is de onvervulde behoefte van de medische gemeenschap voor betrouwbare, niet-invasieve, goedkope en gemakkelijk te gebruiken tools die verschillende stadia van kunnen identificeren en karakteriseren hart-en vaatziekten. Door deze behoefte op te lossen, wordt ervoor gezorgd dat de juiste therapieën snel worden toegepast, wat dramatisch vermindert gezondheidszorgkosten en, belangrijker nog, verbetert de patiëntuitkomst. In feite is aangetoond dat het monitoren van arteriële stijfheid door meting van de aorta-pulsgolfsnelheid een cruciale behoefte zijn voor het beheer van hypertensiepatiënten en het wordt aanbevolen in de European Society of Cardiologische richtlijnen. Daarnaast de vroege identificatie van arteriële stenose en afwijkingen van de hartcontractie kan worden gebruikt om eerdere therapietrouw te stimuleren en de respons van de patiënt bij hart- (valvulaire) aandoeningen te verbeteren. Voortbouwend op de realisaties van het succesvolle CARDIS (H2020-ICT-644798) project, is het doel van InSiDe om de toegang tot een nieuw diagnostisch apparaat versnellen, gebaseerd op siliciumfotonica-technologie, die cardiovasculaire monitoring mogelijk maakt ziekten en om de doeltreffendheid ervan te bewijzen bij het besturen van een instelling voor tijdige therapie en de daarmee verband houdende follow-up.Wij zullen: -Een efficiënte geminiaturiseerde laser Doppler-interferometer ontwikkelen, ondersteund door een maakbaar pakket met geïntegreerde optische beeldvorming en door elektronica voor controle van de laserinterferometer met on-board bijna realtime signaal verwerkingscapaciteit. -Algoritmen ontwikkelen voor vertaling van de interferometersignalen naar beat-to-beat meetresultaten die relevant zijn voor monitoring en diagnose van geselecteerde cardiovasculaire parameters. -Bewijs leveren van de effectiviteit van het apparaat in meerdere klinische haalbaarheidsstudies binnen en buiten het consortium. -Op weg gaan naar industrialisatie en maakbaarheid. Op deze manier zal InSiDe een goedkoop handzaam, robuust diagnosetool realiseren, dat in grote hoeveelheden kan worden geproduceerd. Een diagnostisch hulpmiddel geeft onmiddellijke resultaten voor interpretatie door arts."