Naam Activiteit "Proteïnechemie, proteoomanalyse en epigenetische signalisatie (PPES)" "De cluster Eiwitchemie, proteoomanalyse en epigenetische signalisatie is actief op drie terreinen: neurodegeneratie, infectie en inflammatie. Voor het eerste deel bestudeert de cluster o.a. de gevolgen van hypoxie/ischemie en de rol van heemeiwitten hierin en hoe deze wordt waargenomen in metabool actief weefsel zoals hersenen.. Wat betreft het tweede deel wordt de virus-gastheer relatie, op intra- en extracellulair niveau onderzocht. In het derde deel worden de effecten van omgevingsfactoren (endocriene verstoorders, hormonen, oxidatieve stress, hypoxie, voedingsstoffen) onderzocht in relatie tot eiwit(signaal)functies en (epi)genoomregulatie bij inflammatieprocessen in immuuncellen (monocyten, macrofagen) kanker (CLL, myeloma, borstkanker, neuroblastoma, glioblastoma) en cardiovasculaire endotheelcellen (atherosclerose) . Al deze studies gebeuren op het niveau van eiwitten, proteomen en epigenomen. De volgende topics komen aan bod: Intracellulaire anti-HIV responsen welke gemediëerd worden door het eiwit TRIM19 (PML) worden bestudeerd op het niveau van eiwit-eiwit interacties. Dmv. cDNA cloneringstechnieken wordt een korte aminozuursequentie bevestigd aan PML waardoor eiwitten welke associëren met PML in geïnfecteerde of niet-geïnfecteerde cellen kunnen geïsoleerd en geïdentificeerd worden. Expressie en distributie van andere anti-HIV eiwitten zoals TRIM5¿ en APOBEC3G wordt bestudeerd in immuuncellen (CD4+, CD8+, monocyten¿) van niet-geïnfecteerde, HIV-geïnfecteerde of HIV-resistente personen (ESNs of Exposed Seronegatives). Extracellulaire anti-HIV responsen. Eiwitten en peptiden van cervico-vaginale spoelingen van niet-geïnfecteerde personen worden momenteel geïdentificeerd teneinde een 'catalogus' op te stellen van de verschillende antimicrobiële eiwitten en peptiden welke aanwezig zijn in deze stalen. In een later stadium zullen cervico-vaginale proteomen van niet-geïnfecteerde personen (controles) vergeleken worden met deze van ESNs teneinde correlaties te trekken tussen de proteoom profielen van ESNs en hun anti-HIV status. Hypoxie/oxidatieve stress. De gevolgen van hypoxie en de rol van heemeiwitten hierin worden bestudeerd in metabool actieve weefsels zoals hersenweefsel. Meer specifiek wordt de neuroprotectieve rol van neuro- en cytoglobine onderzocht in vivo en in vitro. Hierbij wordt gebruik gemaakt van transgenese (knock-out en overexpressie in muis en cellulaire modellen) en differentiële proteoomanalyse in modellen van globale en focale hypoxie. Studie van de structuur/functie van globine gebaseerde zuurstofsensors. Het correct meten van de zuurstof concentratie en zijn veranderingen en het hierop adequaat reageren door de cel is een fundamenteel proces. Hierin bestuderen we de structuur/functie van globine gebaseerde zuurstofsensors uit verschillende organismen (o.a. bacteriën, C. elegans) met als doel het beter begrijpen van dit proces in de eukaryote cel. Studie van epigenetische programmering van inflammatieprocessen. Gecontroleerde induceerbare expressie van onstekingsgevoelige genen is essentieel bij immuunreacties en homeostasis. Ontregelde chronische onstekingsprocessen in diverse celtypes zijn daarentegen dikwijls verantwoordelijk voor ontspoorde tumorontwikkeling, cardiovasculaire ziektes en neurologische aandoeningen. Selectiviteit, sterkte en tijdsafhankelijkheid van induceerbare inflammatie-afhankelijke genexpressie wordt bepaald door activatie en interactie van transcriptiefactoren/cofactoren (bvb. NFkB, AP1, Sp1, p53, HDAC, HMT, SIRT, jmjd HDMT, dnmt e.a.) en hun specifieke posttranslationele modificaties, met hun chromatineomgeving. Chromatine-eiwitregulatie (nucleosomen, histonmodificaties) en epigenetische modificaties (DNA-methylatie van CpG-motieven) vormen de ultieme integratieplaats voor signaalwegen geactiveerd door omgevingsfactoren (infectie, inflammatie, stress, metabolisme, voedingsfactoren). Het ontrafelen van de epigenetische wisselwerking van diverse omgevingsfactoren (voeding, stress, pathogenen, toxines, ...) met het genoom in inflammatie-kankermodellen of cardiovasculaire ziektes vormt de hoofdfocus van dit onderzoek. Onze cluster gebruikt voornamelijk, proteoom-, (epi)genoom- en eiwitanalyse-technieken voor het ontrafelen van eiwit(signaal)functies. Hierin is o.a. de flitsfotolyse opstelling die wordt gebruikt voor de studie van de bindingskinetiek enig in België. Specifieke eiwit(signaal)functies kunnen geanalyseerd worden via verschillende expressie en ¿interactiestudies van recombinante eiwitvarianten in vitro/in vivo. Voor epigenoomstudies zal gebruik gemaakt worden van nieuwe generatie chromatine-proteoomanalyses (posttranslationele factor/histonmodificaties) en nieuwe DNA-methylatie-detectiemethodes (bisulfietsequenering, methylatiespecifieke QPCR, pyrosequencing, MALDI, AIMS)" "Moleculaire beeldvorming, Pathologie, Radiotherapie & Oncologie (MIPRO)" "Het onderzoek in het departement Oncologie bestaat uit volgende disciplines : - Oncologie (meest recente projecten : Validatie van Urokinase plasminogeen activator (uPA) als een therapeutisch doelwit en biomerker; Moleculaire karakterisering van circulerende tumorcellen bij patiënten met borstkanker.) - Pathologische anatomie - Nucleaire geneeskunde - Radiotherapie." Zonneënergie "TOPIC A : Model Ontwikkeling en Model Validatie TOPIC B : Simulatie Technologie voor de Bouwsector TOPIC C : Informatioe Technologie voor de Bouwsector TOPIC D : Pre-Normatieve Research voor de Bouwsector(Van de Perre R.) TOPIC E : Component Ontwikkeling - design optimalisatie - test procedures TOPIC F : Energiebesparing en Comfort evaluaties in gebouwen" "Carmeliet Lab" "Peter Carmeliet" "Unraveling the molecular and cellular basis of the formation of blood vessels (angiogenesis) in health and disease, and in particular the role of vascular heterogeneity and vascular metabolism herein, identify novel therapeutic pro- or anti-angiogenic treatments." "Celbiologie en Histologie" "De dienst Celbiologie (CYTO) is gespecializeerd in moleculair en cellulair onderzoek op de lever, met een belangrijke focus op de (patho)biologie van stellaatcellen en progenitorcellen. Prof. A. Geerts stond mee aan de basis van het eerste artikel over isolatie, zuivering en kweek van leverstellaatcellen en is auteur van een celsorteringsmethode om stellaatcellen op te zuiveren tot min. 95%. Leverstellaatcellen spelen een belangrijke rol in: 1) vitamine A metabolisme 2) vorming van extracellulaire matrix 3) pathogenese van fibrose and cirrose 4) regeling van de stroom en druk in de sinusoïden 5) secretie van groeifactoren en cytokines in normale lever en tijdens fysiologische en pathologische regeneratie 6)progressie van primaire of metastatische tumorgroei 7) verbreiding (propagation) van zenuwsignalen Naast deze klassieke functies die men toeschrijft aan leverstellaatcellen , blijkt een subpopulatie een rol te spelen in de vorming van progenitorcel niches." Fysiologie "- Effecten van membraanstructuur op membraaneiwitorganisatie en -eigenschappen in epithelen en hersenweefsel - Myelinisatie in fysiologische en neuroinflammatoire omstandigheden - Rol of neurotransmitters in de ontwikkeling van het zenuwstelsel - Fysiologische en fysiopathologische rol van cys-loop ligand-geactiveerde ionenkanalen - Microglia en neurogenese: implicatie in de ontwikkeling van het zenuwstelsel en in excitabiliteitaandoeningen - Transepitheliaal transport van opgeloste stoffen en water in excretieorganen gemeten door elektrofysiologie en microfluorimetrie - Invloed van toxische stoffen, ischemie, hypoxie en farmaca op niercellen en op de nierfunctie" "Klinische Digestieve Oncologie" "De onderzoekseenheid Klinische Digestieve Oncologie focust op:1.Klinisch onderzoek naar nieuwe behandelingen met een focus op de strategie van de behandeling sequenties en op nieuwe geneesmiddelen, waaronder ook radionucleïde behandeling. Het klinisch onderzoek is ook gericht op het multidisciplinaire managment en de multimodale behandeling van gastro-intestinale tumoren.2. Klinisch onderzoek naar de optimalisatie van diagnostische modaliteiten waaronder respons evaluatie met moderne beeldvormende technieken en functionele beeldvorming met nieuwe PET-tracers en diffusie- en perfusie MRI.3.Het analyseren van erfelijke darmkanker syndromen.4.Impact van screening bij darmkanker.In 3. en 4. is de integratie van geavanceerde endoscopische beeldvorming belangrijk.5.Translationeel onderzoek: prognostische en voorspellende markers voor de uitkomst en de respons van de patiënten behandeld met GI maligniteiten door het analyseren van het bloed en tumoren van patiënten behandeld in Leuven en in nationale of grote internationale klinische studies.6.Het begrijpen van de mechanismen verantwoordelijk voor resistentie en gevoeligheid voor nieuwe geneesmiddelen." "Toegepaste NMR" "De onderzoeksgroep voor `Toegepaste NMR' heeft enerzijds een eigen research area ontwikkeld, maar is omwille van de expertise en de infrastructuur op gebied van Nucleaire Magnetische Resonantie spectroscopie ook open voor collaboratie met talrijke andere onderzoeksgroepen binnen en buiten de Universiteit Antwerpen. Het eigen onderzoek behelst voornamelijk de NMR spectrale studie van stikstofhoudende organische moleculen. Deze stoffen worden gesynthetiseerd in nauwe samenwerking met de onderzoeksgroep `Organische Synthese'. Hierbij gaat de aandacht hoofdzakelijk uit naar palladium gekatalyseerde reacties, al dan niet versneld d.m.v. microgolf bestraling. Het geheel past in een onderzoekslijn naar potentieel nieuwe middelen tegen malaria. Een nieuw project betreffende de NMR studie van biologische vloeistoffen, bvb cerebrospinaal vocht, is in de opstartfase dank zij belangrijke nieuwe investeringen op gebied van apparatuur. Omwille van de NMR infrastructuur aanwezig in onze onderzoeksgroep en in het Interuniversitaire NMR-consortium waartoe onze groep ook behoort, is de dienstverlenende taak naar anderen toe uitgegroeid tot een aanzienlijk deel van de studies die in de groep worden uitgevoerd. De aard van dergelijk werk is zeer uiteenlopend en kan gaan van de studie van kleine hoeveelheden geïsoleerde biomoleculen, over de studie van anorganische complexen tot de studie van (in tonnen geproduceerde) polymeren." "VIB Metabolomics Core Leuven" "Ghesquiere Bart" "Contemporary mass spectometry-based metabolomic services and customized solutions for specific experimental setups." "Betacel Neogenese" "Nico De LeuWillem Staels" "De focus van de onderzoeksgroep BENE is gericht op het (re)generen van functionele beta cellen voor de behandeling van diabetes."