Name "Responsible (Organisation)" "Activity (Organisation)" "Affiliation (Researcher)" "Alejandro Sifrim" "Laboratorium voor Multi-omic Integratieve Bioinformatica, Departement Menselijke Erfelijkheid" "Bernard Thienpont" "Laboratorium voor Functionele Epigenetica, Departement Menselijke Erfelijkheid" "Francesca Bosisio" "Translationeel Cel- en Weefselonderzoek" "Laboratorium voor Reproductieve Genomica" "Thierry Voet" "Onze groep richt zich op:(1) De ontwikkeling van in vitro en computationele methoden voor single-cel multi-omics analyses –inclusief genoom-, epigenoom- en transcriptoomanalyses van individuele cellen– met behulp van microarray en next-generation sequencing-technologieën. We automatiseren deze methoden bovendien met behulp van aangepaste robotica voor vloeistofhandeling en microfluïdica.(2) De toepassing van deze methoden om de aard, snelheid en mechanismen van DNA-mutatie in primaire weefsels en de relatie van somatische mutatie tot fenotype / ziekte-ontwikkeling te bestuderen. We passen deze methoden toe op cellen die voortkomen uit de eerste celdelingen van het leven, om genomische instabiliteit in embryogenese te begrijpen, tot postmitotische cellen als neuronen.(3) De toepassing van deze methoden –die de omvang, aard en biologie van cellulaire heterogeniteit kunnen onthullen– om normale ontwikkelingsprocessen, verouderingsprocessen en ziekteprocessen te begrijpen.(4) Vertaling van single-cel omics methodologieën naar de kliniek. De groep is bijvoorbeeld expert in genoom-wijde haplotype reconstructie van afzonderlijke cellen, wat nu een nieuwe algemene methode is voor de genetische diagnose van pre-implantatie embryo’s in de kliniek." "Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven)" "Stein Aerts" "Het onderzoek in het Laboratorium voor Computational Biology is gericht op gen- en genoom regulatie, met toepassingen in Drosophila en kanker, en op 'integrative genomics', de ontwikkeling van computationele methoden voor genomische data integratie en analyse van 'next-generation sequence data'." "Aerts Lab" "Stein Aerts" "Research on decoding the genomic regulatory code and understanding how genomic regulatory programs drive dynamic changes in cellular states, both in normal and disease processes." "Translationeel Cel- en Weefselonderzoek" "Tania Roskams" "Gebruik van een groot panel van klassieke morfologische technieken incl. enzym- en immunohistochemie, evenals meer geavanceerde moleculaire technieken op weefselsecties, onderzoeken we de histologie en de functie van een verscheidenheid aan menselijke weefsels in normale en in pathologische omstandigheden. Doorheen deze onderzoeksactiviteiten proberen we de beschikbare morfologische technieken voor lichtmicroscopie te optimaliseren , elektronenmicroscopie, incl. transmissie- en scanningmicroscopie & confocale microscopie. Daarnaast wordt bijzondere aandacht besteed aan de ontwikkeling van specifieke protocollen die de toepassing mogelijk maken van recent ontwikkelde moleculaire technieken op DNA en RNA geëxtraheerd uit ingevroren en in paraffine ingebedde weefselcoupes." "Jonas Demeulemeester" "Demeulemeester lab, Laboratorium voor Integratieve Kanker Genomica (VIB-KU Leuven)" "Vanessa Vermeirssen" "Vakgroep Biomedische Moleculaire Biologie, Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde" "Jimmy Van den Eynden" "Vakgroep Structuur en Herstel van de Mens"