Projecten
Dynamieke DNA methylatie profielen onderliggen resistentie tegen therapie in kanker. KU Leuven
Een veelvoud aan DNA-methyleringsveranderingen is geassocieerd met de cellulaire respons op therapie tegen kanker. Er is echter niet systematisch onderzocht hoe deze veranderingen ontstaan, of en hoe ze causaal bijdragen aan therapeutische resistentie en wat hun impact in de kliniek is. In deze studie onderzoeken we daarom of en hoe DNA-methyleringspatronen cellulaire expressie en fenotype-veranderingen kunnen onderliggen waardoor cellulaire ...
Nieuwe Diagnostiek door Methylatie Profilering van Celvrij DNA KU Leuven
Celvrij DNA (cfDNA) wordt steeds vaker gebruikt om ziekten op te
sporen en te karakteriseren. Onlangs hebben methodologische
vorderingen om cfDNA-methylatie te analyseren, en de detectie van
cfDNA in andere lichaamsvloeistoffen dan plasma, het spectrum van
aandoeningen uitgebreid waar cfDNA toepasbaar is.
In een pilootstudie toonden we aan dat cfDNA-methylatie kan
voorspellen welke zwangerschappen pre-eclampsie ...
Deconvolutie van bulk tumor transcriptoom en DNA methylatie data ter identificatie van onderliggende celpopulaties. KU Leuven
In dit project zullen we daarom methoden ontwikkelen om tumorbulg-genexpressie en DNA-methyleringsdata te ontrafelen en de verschillende profielen van de normale en tumorcellen bloot te leggen.
DNA methylatie in Common Variable Immunodeficiencies (CVID): een gedetailleerde studie naar DNA methylatie heterogeniteit en relatie met ziekte klassificatie Universiteit Gent
Common variable immunodeficiencies (CVID) is de meest prevalente primaire immunodeficiency. Het dysfunctionele immuunsysteem bij CVID is niet in staat bescherming te bieden bij infecties. Een subset van de CVID patiënten ontwikkelt ernstige ziekte met comorbiditeiten en dus een slechtere prognose. Slechts zelden wordt er een causaal monogenisch defect gevonden. Flowcytometrie en in mindere mate genetische screening zijn actueel de ...
Dynamische wisselwerking tussen DNA mehtylation, histonmodificaties en de activiteit van super versterkers in de pathogenese van onrijpe T-ALL Universiteit Gent
SulfoMet: Het ontrafelen van biologische functies van epigenetische DNA methylatie in de model-archaeon Sulfolobus acidocaldarius Vrije Universiteit Brussel
mechanisme dat fenotypische diversiteit, ontwikkelingsprocessen en
stressrespons bepaalt. In tegenstelling tot eukaryoten en bacterieën,
is er slechts zeer weinig geweten over de biologische functies van
DNA-methylatie in archaea, welke een aparte fylogenetische groep
vormen. In de thermoacidofiele model-archaeon Sulfolobus
acidocaldarius werd het ...
Ontwikkelen van een gecombineerde screening en moleculaire triage strategie voor cervix kanker gebaseerd op HPV detectie, kwantificatie, genotypering en DNA methylatie in zelf-afgenomen stalen. Universiteit Antwerpen
Onderzoek naar de rol van DNA methylatie in het falende en het verouderende hart KU Leuven
Veroudering is de belangrijkste risicofactor voor hartfalen. Hartspiercellen (cardiomyocyten, CMn) ondergaan leeftijds-geassocieerde veranderingen, leidend tot vermindering van functie, (onder andere) veroorzaakt door maladaptieve aanpassingen aan de hartspier, en hypertrofie van individuele cardiomyocyten. CMn zijn langlevend (decennia), en hebben een gelimiteerde celdelingscapaciteit. Transcriptionele variatie (heterogeniteit) tussen CMn ...
Epigenetische schok: Vroege wijzigingen in DNA methylatie en histon modificaties als onderdeel van de plant immuunrespons Universiteit Gent
Dit onderzoek wil fundamentele inzichten bieden betreffende de rol van vroege DNA hypomethylatie en histon modificatie veranderingen - een fenomeen dat we de epigenetische schok noemen - op de plantimmuniteit. Het focust op twee modelplanten, Arabidopsis en rijst, wat het mogelijk maakt om de evolutionaire conservatie van deze epigenetische schok na te gaan en zo de impact van het project verhoogt. Rijst is één van de belangrijkste ...