Projecten
qPCR systeem voor kwaliteitscontrole van NGS staalvoorbereiding, meting van genexpressie, hybridisatiecurve, en smeltcurve analyse Universiteit Gent
In het UGent NXTGNT NGS sequencing-laboratorium heeft het Roche LightCycler 480 II qPCR-systeem vele UGent-onderzoekers van verschillende faculteiten gediend, en heeft het bijgedragen aan honderden publicaties. Ook tientallen externe universiteiten, instellingen en commerciële partners hebben van het systeem geprofiteerd. De meeste van deze onderzoekers gebruikten het systeem indirect door NGS-staalvoorbereiding uit te voeren in het ...
Correlatie tussen serum en allograft genexpressie patronen in het diagnosticeren en monitoren van nier transplant rejectie. KU Leuven
Een niertransplantatie is de voorkeursbehandeling voor nierziekten in hun eindstadium. Echter, een allo-immune respons gericht tegen de donornier kan aanleiding geven tot rejectie en brengt een verhoogd risico op verminderde werking of verlies van de donornier met zich mee. Afhankelijk van het betrokken immuunmechanisme kan rejectie worden onderverdeeld in antistof gemedieerde rejectie, T-cel gemedieerde rejectie, en een gemengd type ...
Wanneer genomen samenwerken: een onderzoek naar de onmiddellijke effecten van alloploidisatie op fitness op genexpressie Universiteit Gent
Soorten waarvan het genoom is samengesteld uit de volledige genomen van minstens twee oudersoorten worden alloploid genoemd. Allopolyploide planten hebben vaak de capaciteit om nieuwe habitats in te nemen en worden dan ook vaak gekenmerkt door een bredere ecologische niche. De polyploide plasticiteitshypothese stelt dat alloploiden een hogere fitness kunnen bekomen in een brede range van omgevingsomstandigheden door afhankelijk van de ...
Kunnen we het verloop van cognitieve achteruitgang in de ziekte van Alzheimer voorspellen aan de hand van genetische determinanten van differentiële genexpressie in het default-mode netwerk? Universiteit Antwerpen
Epigenetische regulatie van genexpressie door DNA methylatie speelt een belangrijke rol in de resistentie en tolerantie van biofilms: onderzoek naar het achterliggend mechanisme en exploratie van mogelijke farmacologische interventies Universiteit Gent
De hypothese van mijn voorstel is dat regulatie van bacteriële fysiologie door epigenetische regulatie van genexpressie (via DNA methylering) bijdraagt tot de verminderde gevoeligheid van bacteriële biofilms t.o.v. antimicrobiële middelen. Met mijn onderzoek verwacht ik een fundamenteel inzicht te krijgen in hoe DNA-methylatie bijdraagt tot biofilmresistentie in complexe klinische settings. Ik wens daarnaast in een proof-of-concept studie aan ...
Genexpressie profielen indicatief voor blootstelling aan polycyclische aromatische koolwaterstoffen in de baarmoeder in relatie tot de ontwikkeling van ziekte binnen het ENVIRONAGE geboorte cohort. Universiteit Hasselt
Reconstructie van dynamische initiatie en progressie genexpressie regulatorischenetwerken in neuroblastoom Universiteit Gent
Neuroblastoom (NB) is een dodelijke tumor bij kinderen waarvoor therapie beetje over de afgelopen decennia verbeterd en waarvan wordt aangenomen profiteren van inzichten in verstoorde signaalwegen. Onlangs zijn nieuwe genetische componenten in de oncogene signalering in NB cellen ontdekt. Ondanks deze vooruitgang, die nader stroomafwaartse signalering en de relatie tussen deze trajecten blijft ongrijpbaar. Dergelijke kennis is echter cruciaal ...
Ontogenie van geneesmiddel transporters en metabolizerende enzymes in de minipig: een genexpressie analyse Universiteit Antwerpen
Genexpressie geassisteerde compound chemie Universiteit Gent
Het doel is het exploreren van relaties tussen de chemische structuur van compounds and hun in vitro effect op cellijnen zoal gemeten door genexpressie en on-target en off-target bioassays. We onderzoeken ook de mogelijkheid om predictieve modellen te ontwikkelen die gebruikt kunnen worden om gericht de chemische structuur te wijzigen met het oog op het verbeteren van de effecten op de cel. (QSTAR = quantitative structure transcriptional ...