Projecten
Comparatieve genomica van pathogene bacteriën KU Leuven
Omics-technieken en bio-informatica analyses zijn een integraal onderdeel van modern biologisch onderzoek geworden. In dit proefschrift focussen we op hun toepassing in de microbiologie, meer bepaald het domein van bacteriën en hun virussen (fagen). Het voorgestelde werk kan ruwweg verdeeld worden in drie componenten: i) de ontwikkeling van nieuwe bio-informatica methoden mogelijk gemaakt door de introductie van long read sequencing ...
STRESSFLEA-B: Hoe leven in een mozaïek van stressoren - een ecologische genomica benadering bij de watervlo Daphnia. KU Leuven
De evolutionaire genomica van Lassa Virus virulentie en persistentie KU Leuven
Lassa virus (LASV) is een endemisch virus in West Afrika dat elk jaar honderdduizenden infecteert. Mensen worden hoofdzakelijk besmet door contact met knaagdieren van het genus Mastomys die virus uitscheiden via urine en faeces. Ongeveer 80% van de infecties blijven asymptomatisch, maar 1 op 5 LASV infecties resulteren in een acute virale hemorragische ziekte. Er bestaat geen effectieve behandeling of vaccin en er is weinig gekend omtrent de ...
Sturen van translocaties van plantensoorten: gebruik van genomica om de interacties tussen adaptatie aan klimaat en adaptatie aan klimaatsverandering in kaart te brengen KU Leuven
We stellen een uniek geassisteerd migratieraamwerk voor waarin de gecombineerde effecten van klimaatverandering en habitatfragmentatie worden geïntegreerd, om de eerste empirische test van verschillende geassisteerde migratiescenario's te leveren over het persistentie- en adaptieve potentieel van een modelspeciesoort, Primula elatior, in een gefragmenteerd landschap. We vergelijken uitgebreide broeikaseffecten en veldexperimenten met ...
Genomica van erfelijke neuromusculaire ziekten: naar de ontwikkeling van nieuwe biomerkers en therapieën. Universiteit Antwerpen
NXT-EYE: geïntegreerde genomica en transcriptomica voor genidentificatie in erfelijke netvliesaandoeningen Universiteit Gent
Erfelijke retinadegeneratie (RD) is verantwoordelijk voor 5% van de blindheid. Genetische studies hebben onderliggende moleculaire defecten in ~ 50% van de personen met RD, waarvan de meeste in het coderende gedeelte van het genoom onthuld. De komst van de next-generation sequencing (NGS) heeft een revolutie teweeggebracht in de genetische landschap. De enorme hoeveelheid gegevens die door NGS belemmert ziekte genidentificatie, die krachtige ...
Adaptatie en vergelijkende genomica in twee stekelbaarssoorten. KU Leuven
Retinitis pigmentosa: genidentificatie en functionele analyse door geavanceerde genomica en zebravis studies Universiteit Gent
Het doel van dit project is de identificatie van nieuwe ziektegenen voor sporadische of autosomaal recessieve retinitis pigmentosa (RP). Specifieke doelen zijn: (1) prescreening van alle gekende RP genen met next-generation sequencing (NGS); (2) identificatie van nieuwe ziektegenen door homozygositeitsmapping en NGS van kandidaatregioU+2019s; (3) in vivo functionele analyse van nieuwe RP genen in zebravis.