Projecten
PEA histon modificatie proteomics Universiteit Gent
Olink’s baanbrekende proteomics panels helpen wetenschappers bij het ontdekken van menselijke eiwitbiomarkers. Proximity Extension Assay (PEA) -technologie meet tot 1463 unieke eiwitten in 88 monsters tegelijkertijd, startend van minder dan 3 microliter van bijna elk type biologisch monster. Unieke toepassingsdomeinen bevinden zich daar waar massaspectrometrie (MS) gebaseerde proteomics suboptimaal is. Stalen zoals cerebrospinale vloeistof ...
Contextafhankelijke identificatie van kinase-substraatassociatie en eiwitfosforylering door her-analyse op grote schaal van proteomics experimenten. Universiteit Gent
De functie van eiwitten wordt sterk gereguleerd door hun gecoördineerde expressie en interactie in verschillende weefsels en hun juiste lokalisatie binnen verschillende sub-cellulaire compartimenten. Een algemeen mechanisme voor eiwitregulatie zijn posttranslationele modificaties (PTMs). Fosforylering is de meest voorkomende en bestudeerde PTM in eukaryoten, met een rol in ziekten zoals kanker en Alzheimer’s. Deze omkeerbare modificatie wordt ...
Epic Proteomics: een MS-gebaseerde parallelle analyse van histon epigenetica en proteïne-expressie. Universiteit Gent
Door gebruik te maken van nieuwe instrumentele ontwikkelingen en de hierdoor mogelijke nieuwe data-analyse strategieën doel ik om voor het eerst de huidige kaart van de histoncode rechtstreeks te linken aan wijzigingen in het proteoom: een belangrijke tool voor fundamenteel en translationeel onderzoek.
Translationeel onderzoek gerelateerd aan Corona-Covid 19 KU Leuven
De onvoorspelbaarheid van het ziekteverloop van COVID-19 legt een zware druk op het gezondheidssysteem en de economie over de hele wereld. Dit wordt voornamelijk veroorzaakt door een gebrek aan diepgaande kennis over de diverse factoren in de gastheer zelf die de ernst van COVID-19 mee bepalen. Ondanks dat het geweten is dat de immuunrespons tegen SARS-CoV-2 in patiënten sterk ontregeld kan zijn, die dan kan leiden tot opname op de intensieve ...
Cofinanciering core facility - ProGenTomics Universiteit Gent
De ProGenTomics core facility biedt een breed scala aan LC-MS gebaseerde proteomics diensten voor de academische gemeenschap en externe klanten. We streven ernaar om onze diensten en het experimentele ontwerp af te stemmen op de behoeften van het project. Zowel methode ontwikkeling als routine analyses kunnen worden aangevraagd.
Een nieuwe uitdaging in mass spectrometrie: Computationele lipidomics in massaspectrometrische beeldvorming. Universiteit Hasselt
Evaluatie van de structuur van het proteoom in levende cellen Universiteit Gent
Eiwitten reageren snel op diverse stimuli door hun structuur te veranderen. Onlangs is een op massaspectrometrie (MS) gebaseerde methode ontwikkeld om de structurele conformatie van het ganse proteoom te onderzoeken. Deze methode steunt op een kortstondig agerend protease dat beschikbare plaatsen op het oppervlak van eiwitten knipt waarna de deels verknipte peptiden uitgelezen worden via MS; beperkte proteolyse (LiP)-MS. LiP-MS werkt op ...
Ontwerp, synthese en biochemische evaluatie van nieuwe serine protease activiteit gebaseerde probes. Universiteit Antwerpen
Een MALDI-8020 massaspectrometer voor analyse van peptiden en eiwitten. Universiteit Gent
Onze onderzoeksgroepen willen een 17 jaar oude MALDI-gebaseerde massaspectrometer, die niet langer wordt ondersteund (hardware of software) door het bedrijf (Bruker), vervangen voor een Shimadzu MALDI-8020-instrument. Dit instrument is een werkpaard voor routinematige kwalitatieve analyse van peptiden en kleine tot middelgrote eiwitten en zal ook gebruikt worden door UGent-onderzoekers van andere onderzoeksgroepen dan de onze.