Het ontrafelen van de rol van effectoren van wortelgalnematoden in de interactie met tomaatwortels ter controle van de parasiet.

Tomaatwortels worden continu uitgedaagd, o.a. door wortelknobbelnematoden in de bodem. Het succesvol infecteren van een plant vereist eiwit-eiwit-interacties tussen gastheer en parasiet. Om dit proces te onderzoeken koppelt het project Y2H-Seq met TurboID-MS om het eiwitinteractienetwerk dat verantwoordelijk is voor de respons van de tomaatwortels te analyseren en enkele sleutelelementen in dit netwerk te identificeren.

Trefwoorden:targeted metabolomics, TurboID-MS, effectoren, Meloidogyne, transcriptomics (RNA-Seq), plant defense, Tomaat (Solanum lycopersicum), Y2H-Seq

Disciplines:Transcriptomics, Biotechnologie voor landbouw, bosbouw, visserij en aanverwante wetenschappen niet elders geclassificeerd, Proteomics, Bescherming van landbouwgewassen, Cel- en moleculaire biologie van planten