Factoren die de samenstelling en stabiliteit van het bonobo (Pan paniscus) darmviroom verklaren in de dierentuin en het wild

Er zitten biljoenen virussen in de menselijke darm, die pas recent aandacht krijgen in microbioom onderzoek. Mensen vertonen grote individuele specificiteit in hun darm viroom profiel die relatief stabiel blijft doorheen de tijd. De factoren die deze variatie verklaren blijven slecht gekend omdat menselijk onderzoek belemmerd wordt door een gebrek aan methodologische standaardisatie en door de ethische en praktische limitaties van experimenteel en longitudinaal onderzoek. Dierlijke studies, bijvoorbeeld op mensapen, bieden een oplossing door hun verhoogde experimentele controle en leveren nieuwe inzichten in de evolutionaire processen die aan de basis liggen van het ontstaan van het menselijk viroom. In dit project ga ik onderzoeken welke factoren de darm viroom samenstelling van bonobo’s verklaren door gebruik te maken van een ongeëvenaarde dataset die de hele Europese dierentuin populatie omvat en twee wilde Afrikaanse groepen. Door gebruik te maken van ultramoderne viroom analyses onderzoek ik tot in hoeverre gastheer-specifieke kenmerken (geslacht, leeftijd, verwantschap) viroom variatie verklaren in vergelijking met externe factoren (locatie, dieet, sociaal gedrag), gebruik makende van cross-sectionele en longitudinale stalen. Mijn dataset biedt ook een kans op grensverleggend onderzoek naar de rol van het viroom in de aanwezigheid van antibiotica resistente genen in darmbacteriën, wat belangrijke gevolgen kan hebben voor menselijke behandelingsstrategieën.