De zoektocht naar hoogproductieve waterstofoxiderende synthetische gemeenschappen door middel van isolatie, combinatie en predictie.

Waterstofoxiderende bacteriën zijn organismen die een belangrijke rol spelen in een groot aantal microbiële ecosystemen, toch zijn deze relatief weinig bestudeerd. Ze gebruiken waterstof, zuurstof, koolstofdioxide en ammoniak om hun biomassa aan te maken. Het is geweten dat deze micro-organismen hoogkwalitatieve proteïne aanmaken, in samenstelling vergelijkbaar met dierlijk proteïne.Gezien hun interessante metabolische karateristieken zouden deze bacteriën kunnen gebruikt worden om afvalstromen van industriële of agriculturele processen (die vaak verhoogde concentraties van koolstofdioxide en ammoniak bevatten) te valorizeren onder de vorm van proteïne voor veevoeder of zelfs voor menselijke consumptie. Om dit systeem economisch rendabel te maken, moet een hoogproductief systeem ontwikkeld worden met micro-organismen die efficiënt deze afvalstoffen omzetten. In dit project zullen we nieuwe autotrofe waterstofoxideerders en hun heterotrofe commensalen isoleren uit een natuurlijke omgeving. Vervolgens zullen we in vitro synthetische gemeenschappen maken door één soort waterstofoxiderende bacterie te combineren met verschillende combinaties van heterotrofen door middel van een high-throughput kweekmethode. Deze gemeenschappen worden gescoord op hun biomassaproductie. Onze inspanningen in de zoektocht naar hoogproductieve gemeenschappen worden bijgestaan door predictieve modellen, die tegelijkertijd ook inzichten zullen geven in de mechamismes die tot hoge productiviteit leiden.