Epigenetische en Ruimtelijke Single-cell Analyse in de context van Kankerimmunotherapie

Kankerimmunotherapie, meer bepaald immuun-checkpoint inhibitoren (ICB), heeft een paradigmaverschuiving veroorzaakt bij de behandeling van kankers in een gevorderd stadium, maar slechts bij een relatief klein percentage van de kankerpatiënten leiden zulke behandelingen tot een duurzame klinische respons. Tot op heden zijn er nog geen biomerkers die kunnen aangeven welke kankerpatiënten al dan niet baat hebben bij deze therapie. Ten slotte worden veel combinaties van ICB-therapieën momenteel getest in talrijke klinische studies die vaak geen grondige wetenschappelijke onderbouwing hebben. Met dit project willen we ontdekken waarom immunotherapie doeltreffend is bij sommige patiënten door nieuwe inzichten te verkrijgen in de cellulaire en moleculaire mechanismen die aan de basis liggen van intrinsieke resistentie tegen ICB. Hiervoor verzamelen we tumorbiopten van gevorderde hoofd- en hals squameus cel carcinoom patiënten zowel vóór als tijdens ICB en onderzoeken we hoe het tumorecosysteem (i.e. de interactie tussen kankercellen, immuuncellen, fibroblasten…) verandert na therapie. We zullen innovatieve technologiën op single-cell niveau integreren om de therapeutische respons op ICB te monitoren met een ongekende resolutie. We verwachten dat deze dynamische data helpen bij het identificeren van biomarkers die de respons op ICB voorspellen en nieuwe behandelcombinaties onthullen die therapeutische langetermijnresponsen zullen bieden bij patiënten die niet reageren op de therapie.